顺行灌肠置管及肠道冲洗方案启动后粪便微生物组变化评估

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05821309

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：便秘。这是一项前瞻性纵向研究，研究对象为2至18岁、因符合罗马IV标准的慢性功能性便秘而接受临床Malone顺行灌肠控制排便（MACE）阑尾造口术或盲肠造口术的儿童。仅纳入结肠测压（CMS）显示动力完整的患者。顺行灌肠冲洗药物方案将按1：1比例随机分配为PEG 3350和含电解质的PEG 3350。研究统计学家将制定区组随机化方案，并上传至REDCap。甘油和刺激性泻药将由儿科胃肠病学家与儿科普通外科团队共同根据需要进行滴定。由于正在评估微生物组组成形式的客观数据，患者和提供者均不会对泻药随机分组设盲。患者将在结肠动力研究时获取MACE置入前粪便样本，并在MACE置入及开始顺行灌肠后1个月、4个月和8个月时重复采集粪便样本。MACE置入后样本将在标准随访预约时提交。

所有粪便样本将由患者自行采集。样本将使用OMNIgene GUT试剂盒采集，该试剂盒可在室温下稳定DNA长达60天。研究团队采集样本后，样本管将储存在-80摄氏度下，直至所有样本收集完毕并送检测序。MACE前粪便样本将在停用渗透性泻药治疗一周期间采集。如果患者在停用渗透性泻药的一周内未自行排便，则将在开始使用含或不含电解质的PEG 3350进行CMS肠道冲洗后的首次排便时采集粪便。将记录粪便采集是在接受含或不含电解质的PEG 3350进行CMS肠道冲洗之前还是之后。患者将每日进行冲洗

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。