E-GEOD-100833：乌司奴单抗治疗克罗恩病2b期双盲安慰剂对照研究的人血液与肠道活检微阵列分析
该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验，物种为 Homo sapiens，包含一项乌司奴单抗治疗克罗恩病的 2b 期双盲安慰剂对照研究的人血液与肠道活检样本微阵列分析数据
基本信息
资源简介
E-GEOD-100833：乌司奴单抗治疗克罗恩病2b期双盲安慰剂对照研究的人血液与肠道活检微阵列分析
E-GEOD-100833 是一项来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集，物种为 Homo sapiens。该数据集围绕一项乌司奴单抗治疗克罗恩病的 2b 期双盲、安慰剂对照研究展开，包含对人血液样本与肠道活检样本的微阵列分析数据。其英文全称同时点明了研究主题——通过功能基因组学预测网络模型识别炎症性肠病的调控因子。在本站，该数据集归类于消化系统疾病下的“其他”类别，主题标签为“Differential”，即差异表达分析。整体而言，该数据集将临床试验设计与转录组层面的差异表达检测相结合，为研究克罗恩病在药物治疗背景下的基因表达变化提供了数据基础。
【数据集背景】
该数据集所依托的研究聚焦于炎症性肠病（尤其是克罗恩病）的调控机制。研究采用功能基因组学预测网络模型的思路，试图从基因表达数据中识别与疾病相关的调控因子。数据产生于一项针对乌司奴单抗的 2b 期临床试验，该试验采用双盲、安慰剂对照的设计，属于药物临床研究范畴。数据集本身是这一研究中血液与肠道活检样本的微阵列分析结果，属于差异表达类型的实验数据。源站将其收录为 Expression Atlas 实验（Differential），说明其核心用途在于呈现不同条件下基因表达的差异。
【数据内容】
数据集包含对人血液样本和肠道活检样本的微阵列分析数据。物种为 Homo sapiens。主题标签为“Differential”，表明数据以差异表达分析为核心内容。关于样本数量、分组细节、具体基因列表、表达量数值、统计显著性指标等更细粒度的信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ebi.ac.uk，即 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录。源站描述指明该实验为 Expression Atlas experiment (Differential)，物种为 Homo sapiens，并给出了与英文全称一致的研究说明：一项乌司奴单抗治疗克罗恩病的 2b 期双盲、安慰剂对照研究的人血液与肠道活检样本微阵列分析。关于样本采集的具体流程、时间点、地点与伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其差异表达实验的性质，该数据集可用于考察克罗恩病患者在乌司奴单抗治疗背景下血液与肠道活检样本之间的基因表达差异，也可用于与炎症性肠病调控因子识别相关的方法学研究或验证性分析。由于数据同时涉及血液与肠道活检两类样本，适合开展跨组织表达比较的探索。关于该数据集在具体疾病分型、疗效预测或生物标志物筛选中的适用性，源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集以 EBI Expression Atlas 实验记录的形式提供，使用者可按照 Expression Atlas 的差异表达实验数据组织方式进行访问与分析。关于具体的文件格式、下载方式、数据处理流程与推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自一项 2b 期双盲、安慰剂对照临床研究，其设计背景在源站描述中有明确说明。但关于样本量、数据完整性、批次效应、缺失值情况以及任何质量控制指标，源站未提供。使用者应注意，源站描述仅覆盖实验层面的概要信息，未给出可用于评估数据质量的细节。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-100833
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas实验（差异表达）。物种：Homo sapiens。一项功能基因组学预测网络模型识别出炎症性肠病的调控因子：来自乌司奴单抗治疗克罗恩病的2b期、双盲、安慰剂对照研究的人体血液和肠道活检样本的微阵列分析
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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