常见宿主种群遗传结构预测白鼻综合征传播的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.v1v13

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数据集大小约 160.0 MB。

数据说明

景观复杂性影响动物的扩散模式，进而可能影响基因流动和病原体的传播。白鼻综合征（WNS）是一种外来真菌性疾病，已在北美东部迅速蔓延，导致蝙蝠种群大量死亡。我们通过评估北美东部冬眠群体中WNS风险的逻辑回归模型，检验了最常见宿主——小棕蝠（Myotis lucifugus）的种群遗传结构与WNS迄今为止的地理传播之间的关系。我们假设，易感宿主群体感染WNS的风险应随与感染群体的地理邻近度和遗传相似性（反映历史连通性）的增加而增加。与这一假设一致，纳入感染群体与易感群体之间的遗传距离显著改善了疾病传播模型，尽管东部种群间遗传分化水平较低，但仍捕捉到了WNS空间扩展的异质性。

将我们的遗传分析扩展至小棕蝠的大陆分布范围后，揭示了北美东部与西部之间种群结构模式的强烈反差。向西进入北部大平原、超出WNS当前分布范围后，遗传结构显著增加。在北美西部，地理上邻近种群的遗传分化往往超过整个东部地区所观察到的水平，这表明扩散频率低和/或扩散范围局部受限，因此北美西部病原体引入的机会相对有限。综合来看，我们的分析表明，WNS病原体未来的传播速度可能较慢，至少在小棕蝠介导的范围内如此。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。