实验感染禽疟原虫SGS1谱系的红交嘴雀血液转录组测序数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.93pj0

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 849.6 KB。

数据说明

为了从地理和宿主物种两个角度理解这种禽疟疾感染的流行病学，需要更多多态性标记以及关于宿主感染期间表达基因的知识。然而，技术困难阻碍了此类分子标记的开发。主要困难在于宿主（鸟类）具有有核红细胞，且宿主与寄生虫之间的基因组大小存在52倍的差异。这导致在尝试分离和扩增禽疟疾寄生虫的新核基因时遇到问题。为了克服这一困难并获得核基因的分子数据，我们对实验感染了Plasmodium relictum SGS1谱系的普通交嘴雀的血液转录组进行了测序。在血液中发育期间，寄生虫经历数轮无性发育（红细胞内裂体增殖），并侵入大量宿主细胞，因此预期具有高水平的基因表达。

这些数据将为有兴趣开发更多分子标记并研究禽疟疾寄生虫红细胞发育阶段表达基因的研究人员提供资源。我们希望借助这些数据，迈出理解其表现出的宿主广谱性背后机制的第一步，并理解不同禽疟疾谱系如何在全球传播。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。