DRA缺陷小鼠多区室代谢重塑与溃疡性结肠炎代谢特征重叠的数据及详细方法

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.21704234

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本仓库包含支持手稿《DRA缺陷小鼠中的多区室代谢重塑与溃疡性结肠炎代谢特征重叠》的详细方法和研究特异性衍生数据。存放的材料包括小鼠多组学样本元数据；小鼠结肠RNA-seq差异表达结果及KEGG代谢聚焦分析；结肠黏膜、粪便和血清在正离子和负离子模式下的处理后非靶向LC–MS代谢组学数据表；靶向血清和粪便胆汁酸数据；属水平16S rRNA微生物组数据；MetOrigin代谢物来源归属及宿主–微生物群共代谢结果；转录组–代谢组通路水平整合；以及来自六队列人类溃疡性结肠炎分析的衍生结果，该分析考察了KEGG代谢通路改变、SLC26A3/DRA表达及UC内DRA–通路关联。小鼠结肠RNA-seq原始FASTQ文件可通过NCBI Sequence Read Archive在BioProject PRJNA1345427下获取。原始非靶向LC–MS代谢组学数据可通过GNPS/MassIVE获取，正离子模式登录号为MSV000099473，负离子模式登录号为MSV000099476。

详细的统计定义、多重检验程序、分析参数以及各图特定的显著性标准，均在随附的《详细方法》文档中提供。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。