PRJNA1466835：移植奶山羊粪便菌群小鼠的16S rRNA数据
该数据集包含接受腹泻奶山羊与健康奶山羊粪便菌群移植（FMT）的小鼠粪便样本16S rRNA基因测序数据。研究将腹泻奶山羊（D-FMT）和健康奶山羊（H-FMT）的粪便菌群移植到小鼠体内，移植后采集粪便样本，使用Illumina平台对16S rRNA基因V3-V4区进行测序
基本信息
资源简介
PRJNA1466835：移植奶山羊粪便菌群小鼠的16S rRNA数据
该数据集为PRJNA1466835，收录于NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），主题标签为原始测序读长（Raw sequence reads），本站分类归入消化系统疾病/腹泻方向。其核心内容是接受腹泻奶山羊与健康奶山羊粪便菌群移植（FMT）的小鼠粪便样本的16S rRNA基因测序数据。研究将腹泻奶山羊来源的粪便菌群（D-FMT）与健康奶山羊来源的粪便菌群（H-FMT）分别移植到小鼠体内，在移植后采集小鼠粪便样本，并针对16S rRNA基因的V3-V4区域采用Illumina平台进行测序。通过比较两组受体小鼠的微生物群落结构、多样性和组成，该数据集旨在探讨肠道菌群在奶山羊腹泻中的作用，帮助识别与腹泻相关的微生物类群，并为菌群失调与奶山羊腹泻发病机制之间的关联提供证据。
【数据集背景】
腹泻是奶山羊养殖中常见的消化道问题，其发生发展与肠道微生物群落的改变密切相关。为在可控的实验条件下研究肠道菌群在腹泻中的作用，该研究采用粪便菌群移植（FMT）的方式，将腹泻奶山羊和健康奶山羊的粪便微生物分别转移到小鼠体内，构建受体小鼠模型。通过比较接受不同来源菌群的小鼠，可以在一定程度上排除宿主遗传背景和环境的混杂影响，聚焦菌群本身对腹泻相关表型的作用。该数据集正是围绕这一研究目标产生的16S rRNA基因测序数据，属于消化系统疾病/腹泻方向的基础微生物组研究资源。
【数据内容】
该数据集包含的是16S rRNA基因测序数据，具体为原始测序读长（Raw sequence reads）。测序对象为接受粪便菌群移植后的小鼠粪便样本。测序区域为16S rRNA基因的V3-V4区，测序平台为Illumina平台。数据覆盖两类受体小鼠：接受腹泻奶山羊粪便菌群移植的D-FMT组，以及接受健康奶山羊粪便菌群移植的H-FMT组。研究关注的核心指标包括微生物群落结构、多样性以及组成，并据此比较两组受体小鼠之间的差异，以识别与腹泻相关的微生物类群。除上述内容外，源站未提供更详细的样本数量、测序深度、数据量或具体文件列表等信息。
【采集与来源】
样本来源为接受粪便菌群移植的小鼠。粪便菌群的供体分为两类：腹泻奶山羊和健康奶山羊。研究将腹泻奶山羊的粪便菌群（D-FMT）和健康奶山羊的粪便菌群（H-FMT）分别移植到小鼠体内。移植完成后，采集小鼠的粪便样本用于后续测序。测序针对16S rRNA基因的V3-V4区域，使用Illumina平台完成。该数据集来源于NCBI，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。关于供体奶山羊的具体饲养条件、小鼠的品系、饲养环境、移植剂量与频次、采样时间点等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肠道微生物组相关研究，尤其是围绕腹泻与菌群失调关系的分析。具体而言，可用于比较腹泻来源菌群与健康来源菌群在受体小鼠肠道中的定植差异，分析微生物群落结构、多样性和组成的变化，识别可能与腹泻相关的微生物类群。此外，也可作为粪便菌群移植（FMT）实验研究的参考数据，用于方法学比较、跨物种菌群移植研究，以及消化系统疾病/腹泻方向的微生物组数据挖掘与二次分析。由于数据为16S rRNA基因V3-V4区测序，适合进行细菌群落分类组成和多样性分析，不适用于需要全基因组或功能基因信息的分析场景。
【使用方法】
使用该数据集时，通常先获取原始测序读长数据，然后进行质量控制、去噪或聚类，获得可操作的分类单元或扩增子序列变体，再结合参考数据库进行物种注释。随后可计算Alpha多样性和Beta多样性，比较D-FMT组与H-FMT组受体小鼠粪便样本的微生物群落差异，并通过组成分析识别两组之间丰度存在差异的微生物类群。分析结果可用于探讨菌群失调与腹泻表型之间的关联。关于具体的分析流程、软件参数、参考数据库版本等，源站未提供，需使用者根据研究目的自行确定。
【质量与限制】
该数据集为原始测序读长，未在源站描述中提供质控后的数据或分析结果，因此使用前需要自行完成质量控制和后续生物信息学处理。数据基于16S rRNA基因V3-V4区测序，主要反映细菌群落的分类组成和相对丰度，不能直接推断功能基因表达或代谢通路活性。研究采用小鼠作为受体模型，其结果外推到奶山羊或其他宿主时需谨慎。此外，源站未提供样本量、测序深度、重复设置、批次信息等关键细节，可能影响对数据稳健性和统计效力的评估。上述未提及的信息均属于源站未提供的内容。
【引用与许可】
该数据集来源于NCBI，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名为PRJNA1466835: 16S rRNA data of mice transplanted with dairy goat fecal microbiota。关于具体的引用方式、作者列表、发表文献、数据许可协议及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应访问NCBI对应页面获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1466835
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集包含接受腹泻奶山羊和健康奶山羊粪便微生物移植(FMT)的小鼠粪便样本的16S rRNA基因测序数据。本研究旨在通过比较受体小鼠之间的微生物群落结构、多样性和组成，探究肠道微生物群在山羊腹泻中的作用。将腹泻奶山羊(D-FMT)和健康奶山羊(H-FMT)的粪便微生物移植到小鼠体内。移植后收集粪便样本，并使用Illumina平台对16S rRNA基因V3-V4区域进行测序。研究结果将有助于识别与腹泻相关的微生物分类群，并为肠道菌群失调与奶山羊腹泻发病机制之间的联系提供证据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
