克罗恩病患者来源大肠杆菌在CaCo细胞系黏附侵袭后的蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD014250

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从克罗恩病（CD）患者中分离出三株AIEC菌株。我们分析了三种类型的细胞：黏附前和黏附-侵袭（对照）、黏附-侵袭后以及侵袭后。采用非靶向无标记自下而上蛋白质组学实验对蛋白质进行评估，使用IDA方法（即信息依赖性采集），在Sciex TripleTOF 6600 Q-TOF质谱仪上进行，并通过MaxQuant软件进行LFQ（非标记定量）。数据集涵盖54个样本（三个生物学重复和两个技术重复）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。