人肠系膜组织脂肪生成数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE278661),聚焦人肠系膜组织的脂肪生成,属于消化系统疾病/克罗恩病方向。数据包含克罗恩病患者的肠道爬行脂肪(ICF)与对应肠道非炎症脂肪(INF),以及健康对照的正常肠系膜组织(NL),采用单核 RNA 测序构建图谱

基本信息
资源简介
人肠系膜组织脂肪生成数据集
Adipogenesis of human mesenteric tissue
该数据集来自 NCBI GEO(GSE278661),聚焦人肠系膜组织的脂肪生成,属于消化系统疾病/克罗恩病方向。数据包含克罗恩病患者的肠道爬行脂肪(ICF)与对应肠道非炎症脂肪(INF),以及健康对照的正常肠系膜组织(NL),采用单核 RNA 测序构建图谱。可用于刻画肠系膜组织细胞群体的疾病相关变化,并探索爬行脂肪形成的潜在细胞与分子机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):爬行脂肪(CrF)定义为围绕炎症肠段的肠系膜脂肪组织增生,是克罗恩病的特征性病理表现,并与疾病进展和术后复发相关。为研究 CrF 形成背后的细胞组成和转录改变,我们构建了来自克罗恩病患者和健康对照的人肠系膜组织的单核 RNA 测序图谱。该数据集包括克罗恩病患者的肠道爬行脂肪(ICF)和对应的肠道非炎症脂肪(INF),以及健康对照的正常肠系膜组织(NL)。这些数据用于刻画肠系膜组织细胞群体的疾病相关变化,并探索参与 CrF 形成的潜在细胞和分子机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:消化系统疾病/克罗恩病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278661
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 13 202,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
爬行脂肪(Creeping fat, CrF)定义为炎症肠段周围肠系膜脂肪组织的增生,是克罗恩病的特征性病理表现,并与疾病进展和术后复发相关。为探究CrF形成背后的细胞组成和转录改变,我们构建了克罗恩病患者和健康对照者肠系膜组织的人单核RNA测序图谱。该数据集包括克罗恩病患者的肠道爬行脂肪(intestinal creeping fat, ICF)及相应的肠道非炎症脂肪(intestinal non-inflamed fat, INF),以及健康对照者的正常肠系膜组织(normal mesenteric tissue, NL)。这些数据用于表征肠系膜组织细胞群中与疾病相关的改变,并探索参与CrF形成的潜在细胞和分子机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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