CoMPAS 胃肠组织病理学数据集 第1-2部分

Syed 实验室正在开展一项由 NIH 资助的研究,该研究正在建立并使用一个由存档临床组织病理学图像和患者数据组成的数据集,这些数据来自 Duke 临床档案(Duke BioRepository and Precision Pathology center;BRPC)

Duke UniversityDuke University
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2026-08-11 更新
浏览 10
医学影像分类CoMPAS克罗恩病溃疡性结肠炎炎症性肠病IBD组织病理学回肠
CoMPAS GI Histopathology Part 1-2

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2026-08-11
版本
1.0.0

资源简介

CoMPAS 胃肠组织病理学数据集 第1-2部分

Syed 实验室正在开展一项由 NIH 资助的研究,该研究正在建立并使用一个由存档临床组织病理学图像和患者数据组成的数据集,这些数据来自 Duke 临床档案(Duke BioRepository and Precision Pathology center;BRPC)

CoMPAS GI Histopathology Part 1-2

【数据集背景】

源站首次发布:2026-08-05。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Syed 实验室正在开展一项由 NIH 资助的研究,该研究正在建立并使用一个由存档临床组织病理学图像和患者数据组成的数据集,这些数据来自 Duke 临床档案(Duke BioRepository and Precision Pathology center;BRPC)。这些存档记录通过 DUHS IRB Pro00117942 并在豁免知情同意的情况下获得。我们正寻求按照 NIH 指南,使我们去标识化的组织病理学切片和元数据数据集开放获取。切片由 Duke BRPC 数字化并去标识化,最终存储目前位于 Duke T 盘。元数据收集于 Duke REDCap 数据库,存储在 PRCC,由 PRCC honest broker 去标识化,随后与图像一起存储在同一 T 盘。该数据集将包含约 500 GB 的图像(总计约 550 张图像)和少量额外元数据,以 excel 表格或 .csv 文件形式存储。

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.5281/zenodo.21810305。

【主题与分类】

主题标签:CoMPAS、克罗恩病、溃疡性结肠炎、炎症性肠病、IBD、组织病理学、回肠。本站分类:消化系统疾病/克罗恩病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/21810305

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-08-11,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/records/21810305

(注册/登录后按页面指引下载)

数据说明

Syed实验室正在开展一项由NIH资助的研究,该研究建立并使用了一个数据集,其中包含来自Duke临床档案(Duke BioRepository and Precision Pathology center;BRPC)的存档临床组织病理学图像和患者数据。这些存档记录是通过DUHS IRB Pro00117942并在豁免知情同意的情况下获得的。根据NIH指南,我们正在寻求将我们的去标识化组织病理学切片和元数据集开放获取。切片由Duke BRPC进行数字化和去标识化处理,最终存储目前位于Duke T盘。元数据收集于Duke REDCap数据库,存储在PRCC中,由PRCC honest broker进行去标识化处理,随后与图像一起存储在同一T盘中。该数据集将包含约500 GB的图像(总计约550张图像)以及少量额外元数据,以Excel表格或.csv文件形式存储。BRPC将在7月中旬完成图像准备工作,届时我们希望在一份手稿准备期间提前实现开放获取。不会上传相关软件或代码,仅为满足开放获取合规性而上传数据集。

许可

cc-by-4.0

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