黏液罗氏菌干预洛哌丁胺诱导便秘小鼠模型：16S rRNA肠道菌群分析与PacBio HiFi全基因组测序
数据可用于研究该菌株对便秘模型小鼠肠道微生物组成的影响，并支持菌株基因组组装与分类分析（来源 NCBI）。BioProject 是與單一計劃相關的生物數據集合，來源於單一組織或聯盟
基本信息
资源简介
黏液罗氏菌干预洛哌丁胺诱导便秘小鼠模型：16S rRNA肠道菌群分析与PacBio HiFi全基因组测序
PRJNA1348869 是一个聚焦于消化系统疾病中便秘问题的生物项目，其完整英文名称为“Rothia mucilaginosa intervention in a loperamide-induced constipation mouse model: 16S rRNA gut microbiome profiling and PacBio HiFi whole-genome sequencing”。该项目通过 NCBI 的 BioProject 平台发布，归类于消化系统疾病 / 便秘方向，主题标签为“Raw sequence reads”。从名称可以看出，该数据集围绕黏膜罗斯氏菌（Rothia mucilaginosa）在洛哌丁胺诱导的便秘小鼠模型中的干预效果展开，同时包含 16S rRNA 肠道微生物组谱分析和 PacBio HiFi 全基因组测序两类数据。BioProject 作为与单一计划相关的生物数据集合，来源于单一组织或联盟，为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。该数据集可用于研究该菌株对便秘模型小鼠肠道微生物组成的影响，并支持菌株基因组组装与分类分析。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库。BioProject 是一个与单一计划相关的生物数据集合，来源于单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个单一入口，以便找到为该项目生成的多种数据类型所对应的链接。本站将其归类于消化系统疾病 / 便秘方向，主题标签为“Raw sequence reads”。项目名称明确指向黏膜罗斯氏菌干预、洛哌丁胺诱导的便秘小鼠模型、16S rRNA 肠道微生物组谱分析以及 PacBio HiFi 全基因组测序这几个核心要素，说明该项目的设立与便秘相关肠道微生物研究及菌株基因组研究有关。
【数据内容】
该数据集包含的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。从项目名称可知，数据涉及两个主要方面：一是 16S rRNA 肠道微生物组谱分析，二是 PacBio HiFi 全基因组测序。前者通常用于刻画肠道微生物群的组成，后者通常用于菌株水平的基因组组装与分类分析。关于样本数量、测序深度、具体序列条数、数据文件大小等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 记录，源站标题为“BioProject - NCBI”。项目涉及洛哌丁胺诱导的便秘小鼠模型，并包含黏膜罗斯氏菌的干预。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、实验动物品系、饲养条件、干预剂量与周期等，源站未提供。
【适用场景】
根据侧写线索，该数据可用于研究该菌株对便秘模型小鼠肠道微生物组成的影响，并支持菌株基因组组装与分类分析。具体而言，16S rRNA 肠道微生物组谱分析数据可用于探索干预前后肠道微生物组成的变化；PacBio HiFi 全基因组测序数据可用于该菌株的基因组组装以及分类学分析。关于其他潜在应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供，用户可通过 BioProject 记录找到为该项目生成的多种数据类型所对应的链接。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件参数、参考数据库等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明提供的是原始序列读长。关于数据质量评分、测序错误率、覆盖度、组装指标、污染评估等质量相关信息，源站未提供。关于该数据集在样本量、实验设计、统计效力等方面的限制，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1348869
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含一项洛哌丁胺诱导的便秘小鼠研究中的测序数据，该研究进行了粘液罗氏菌干预。数据集包括：（1）来自三组（NC，n=8；MC，n=8；RG，n=10；总计n=26）肠道微生物组样本的16S rRNA基因扩增子测序，以及（2）干预所用粘液罗氏菌菌株BNCC363031的PacBio HiFi全基因组测序。16S rRNA V4区在Illumina MiSeq平台上测序。菌株基因组在PacBio Revio平台上测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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