PRJNA1365323:用于缓解儿童功能性便秘的芽孢杆菌益生菌

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1365323,主题为用于缓解儿童功能性便秘的芽孢杆菌益生菌,属于消化系统疾病下的儿童便秘方向,主题标签为 Raw sequence reads

sra
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基因组Raw sequence reads
PRJNA1365323: Bacillus Spore Probiotics for Alleviating Functional Constipation in Children

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1365323:用于缓解儿童功能性便秘的芽孢杆菌益生菌

PRJNA1365323 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的公开项目记录,其英文名称为“Bacillus Spore Probiotics for Alleviating Functional Constipation in Children”。该项目围绕用于缓解儿童功能性便秘的芽孢杆菌益生菌展开,在分类上归属于消化系统疾病下的儿童便秘方向,主题标签为“Raw sequence reads”。BioProject 作为生物数据的集合,通常关联某一项由单一机构或联合体发起的研究计划,并为用户提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集因此可作为了解相关研究原始序列读取数据的入口,服务于对儿童功能性便秘与益生菌干预感兴趣的研究人员。

【数据集背景】

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1365323,项目主题为用于缓解儿童功能性便秘的芽孢杆菌益生菌。功能性便秘是儿童群体中常见的消化系统问题,而益生菌干预是相关研究关注的方向之一。该 BioProject 记录来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 BioProject 体系。根据源站描述,BioProject 是围绕单一研究计划组织的生物数据集合,这些计划可来自单一组织或联合体;每条 BioProject 记录为用户提供一个统一位置,用于发现该项目所产生的不同类型数据的链接。该数据集在分类上被归入消化系统疾病 / 儿童便秘,主题标签为 Raw sequence reads,表明其数据内容与原始序列读取相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,说明其涉及的数据类型为原始序列读取。源站描述指出,BioProject 记录提供用户一个单一位置,以查找为该项目生成的不同数据类型所对应的链接。因此,该数据集的内容应围绕 PRJNA1365323 这一项目所关联的原始序列读取数据展开。除主题标签所指示的原始序列读取外,关于具体样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1365323。源站标题为“ID 1365323 - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 记录可来自单一组织或联合体,并为用户提供查找该项目多种数据类型链接的统一入口。关于该项目的具体提交机构、样本采集地点、采集时间、受试者招募方式、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注儿童功能性便秘与芽孢杆菌益生菌关系的研究场景,尤其是需要获取或检索相关原始序列读取数据的研究人员。由于主题标签为 Raw sequence reads,它可能用于支撑与该项目相关的序列数据分析、再分析或方法学参考。其分类归属为消化系统疾病 / 儿童便秘,因此也可作为该领域数据检索与整合的入口。关于具体的分析用途、可支持的结论类型或临床转化方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 NCBI BioProject 记录,用户可通过 NCBI BioProject 体系访问编号 PRJNA1365323,并借助该记录查找为该项目生成的不同数据类型所对应的链接。源站描述强调,BioProject 记录提供用户一个单一位置来发现这些链接。关于具体的数据下载方式、文件组织、分析流程、软件工具或参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开数据库记录。其主题标签为 Raw sequence reads,分类为消化系统疾病 / 儿童便秘。关于数据质量评估指标、原始序列读取的质控情况、覆盖度、批次效应、样本代表性、潜在偏倚以及使用限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA1365323,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用协议或授权要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1365323

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目旨在表征功能性便秘学龄前儿童在接受多株芽孢杆菌孢子益生菌干预前后的肠道菌群特征。收集了接受益生菌或安慰剂补充的儿童粪便样本,以及健康对照儿童的样本,用于生成16S rRNA基因测序图谱。该数据集支持对微生物多样性、分类组成以及益生菌相关的肠道菌群结构变化进行分析。这些测序数据为了解与功能性便秘相关的微生物组变化以及基于芽孢杆菌的益生菌干预对幼儿的潜在影响提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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