结肠腺癌lncRNA相关ceRNA网络分析及潜在lncRNA生物标志物研究补充材料

该数据集包含结肠腺癌的基因表达数据,涉及lncRNA、miRNA和mRNA三种分子模态,来源于TCGA的521个组织样本。通过构建ceRNA调控网络,识别了与疾病相关的特异性分子,并进行了临床关联和功能富集分析,主要用于研究结肠腺癌的分子机制、探索潜在的lncRNA生物标志物,并为ceRNA网络在肿瘤发展中的作用提供数据基础。

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2018-09-19 更新
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结肠腺癌生物标志物ceRNA网络分析

基本信息

创建/更新时间
2018-09-19

资源简介

该数据集是结肠腺癌(COAD)中长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)的ceRNA(竞争性内源RNA)网络分析的补充材料。数据来源于癌症基因组图谱(TCGA),包含521个样本(480个肿瘤组织和41个癌旁组织)的基因表达数据。通过差异表达分析,识别出258个特异性lncRNA、206个特异性miRNA和1467个特异性mRNA,并构建了lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络。数据集还包含与患者总生存期相关的lncRNA的临床关联分析、潜在靶基因的GO和KEGG富集分析结果,以及通过qRT-PCR实验验证的部分数据。该数据集主要用于研究结肠腺癌的分子机制、发现潜在的lncRNA生物标志物,并为ceRNA网络在肿瘤中的作用提供数据支持。

原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Supplementary_Material_for_Analysis_of_lncRNA-Associated_ceRNA_Network_Reveals_Potential_lncRNA_Biomarkers_in_Human_Colon_Adenocarcinoma/7105325

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数据说明

该数据集是结肠腺癌(COAD)中长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)的ceRNA(竞争性内源RNA)网络分析的补充材料。数据来源于癌症基因组图谱(TCGA),包含521个样本(480个肿瘤组织和41个癌旁组织)的基因表达数据。通过差异表达分析,识别出258个特异性lncRNA、206个特异性miRNA和1467个特异性mRNA,并构建了lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络。数据集还包含与患者总生存期相关的lncRNA的临床关联分析、潜在靶基因的GO和KEGG富集分析结果,以及通过qRT-PCR实验验证的部分数据。该数据集主要用于研究结肠腺癌的分子机制、发现潜在的lncRNA生物标志物,并为ceRNA网络在肿瘤中的作用提供数据支持。

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