11例胆道闭锁患者与9例年龄匹配健康对照血清样本的蛋白质组学分析
Yuan Li (2025). 11例胆道闭锁患者与9例年龄匹配健康对照血清样本的蛋白质组学分析 [数据集]。主题标签：胆道闭锁、蛋白质组学、血清样本、消化系统疾病、病例对照、PRIDE
基本信息
资源简介
11例胆道闭锁患者与9例年龄匹配健康对照血清样本的蛋白质组学分析
Yuan Li 于 2025 年发布了一套针对胆道闭锁的血清蛋白质组学数据集，收录于 PRIDE 数据库，项目编号为 PXD029469。该数据集以 11 例胆道闭锁患者和 9 例年龄匹配的健康对照为研究对象，围绕血清样本开展蛋白质组学分析，属于消化系统疾病领域中胆道闭锁方向的数据资源。数据集的核心价值在于通过病例对照设计，为研究者提供胆道闭锁患者与健康儿童血清蛋白质表达层面的原始数据，可用于探索与该疾病相关的潜在蛋白标志物及病理机制。数据集来源站为 ebi.ac.uk，主题标签涵盖胆道闭锁、蛋白质组学、血清样本、消化系统疾病、病例对照和 PRIDE，便于在相关数据库中检索与定位。
【数据集背景】
胆道闭锁是一种发生于婴幼儿期的严重消化系统疾病，以肝外胆管进行性炎症和纤维化闭塞为特征，若不及时干预可导致胆汁淤积性肝损伤乃至肝衰竭。该数据集正是在这一疾病背景下构建的，旨在从血清蛋白质组层面比较胆道闭锁患者与年龄匹配健康对照之间的差异。研究采用病例对照设计，纳入 11 例胆道闭锁患者和 9 例年龄匹配的健康对照，通过血清样本的蛋白质组学分析，为理解该疾病的分子改变提供数据基础。数据集由 Yuan Li 于 2025 年发布，收录于 PRIDE 数据库，项目编号 PXD029469。
【数据内容】
该数据集的内容为血清样本的蛋白质组学分析数据，样本来自 11 例胆道闭锁患者和 9 例年龄匹配的健康对照。数据集英文名称为“proteomic analysis of serum samples of 11 biliary stresia pateints and 9 age matched healthy controls”，中文可表述为“11 例胆道闭锁患者与 9 例年龄匹配健康对照血清样本的蛋白质组学分析”。从主题标签来看，数据涉及胆道闭锁、蛋白质组学、血清样本、消化系统疾病、病例对照以及 PRIDE 等关键词。除上述样本数量、样本类型和分组信息外，源站未提供关于具体蛋白鉴定数量、定量结果、差异蛋白列表或原始谱图文件构成等更细粒度的内容描述。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，具体收录于 PRIDE 数据库，项目编号为 PXD029469。数据由 Yuan Li 于 2025 年发布，引用信息为：Yuan Li (2025). proteomic analysis of serum samples of 11 biliary stresia pateints and 9 age matched healthy controls [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029469。样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、样本处理流程及质谱平台参数等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胆道闭锁相关的蛋白质组学研究，尤其是基于血清样本的病例对照分析。研究者可利用该数据探索胆道闭锁患者与年龄匹配健康对照之间在血清蛋白质层面的差异，用于潜在生物标志物的发现、疾病分子机制研究以及后续验证研究的假设生成。同时，该数据集也可作为消化系统疾病蛋白质组学研究的参考数据，用于方法学比较或与其他胆道闭锁数据集进行整合分析。由于数据集采用病例对照设计并强调年龄匹配，适合用于控制年龄因素影响的比较研究。
【使用方法】
该数据集可通过 PRIDE 数据库的项目编号 PXD029469 进行访问和下载，具体链接为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029469。使用者可根据 PRIDE 平台提供的数据组织方式获取相应文件，并结合蛋白质组学分析软件进行数据处理、蛋白鉴定与定量分析。在使用过程中，建议结合病例对照分组信息进行差异比较。关于数据的具体文件格式、下载方式、分析流程及软件参数等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本量为 11 例胆道闭锁患者和 9 例年龄匹配健康对照，属于小样本病例对照研究，在统计功效和结果外推方面可能存在一定局限。数据集仅涉及血清样本的蛋白质组学分析，未涵盖其他类型样本或其他组学层面。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、技术重复以及验证实验结果等，源站未提供。使用者应在充分了解样本量和研究设计的基础上谨慎解读分析结果。
【引用与许可】
引用该数据集时，应使用以下信息：Yuan Li (2025). proteomic analysis of serum samples of 11 biliary stresia pateints and 9 age matched healthy controls [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029469。关于该数据集的许可协议、使用条款及再分发限制等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029469
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Yuan Li (2025). proteomic analysis of serum samples of 11 biliary stresia pateints and 9 age matched healthy controls [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029469
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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