全基因APC缺失导致典型家族性腺瘤性息肉病,而非衰减型息肉病或“多发性”结直肠腺瘤
该数据集包含对203例家族性腺瘤性息肉病(FAP)患者的基因突变分析数据,主要涉及APC基因外显子14缺失的检测结果,数据模态为基因测序与临床表型信息,旨在研究全基因APC缺失与典型息肉病表型的关联,为遗传性结直肠癌的基因诊断与表型预测提供依据。
基本信息
资源简介
本数据集研究家族性腺瘤性息肉病(FAP)的遗传基础,重点关注APC基因(染色体5q21)的种系突变。数据集包含对60例典型息肉病(腺瘤数超过100个)和143例衰减型息肉病/多发性腺瘤(腺瘤数为3-99个)患者的分析,这些患者此前未检测到明显的APC种系突变。通过实时定量多重PCR技术检测APC外显子14缺失,发现缺失仅存在于典型息肉病患者中(7/60,12%),且多数缺失覆盖整个APC基因位点,表明单倍体不足可导致典型息肉病表型。该研究为APC突变阴性典型息肉病患者的基因筛查提供了依据,适用于遗传性结直肠癌、基因突变分析与疾病表型关联等研究方向。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC122454/
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本数据集研究家族性腺瘤性息肉病(FAP)的遗传基础,重点关注APC基因(染色体5q21)的种系突变。数据集包含对60例典型息肉病(腺瘤数超过100个)和143例衰减型息肉病/多发性腺瘤(腺瘤数为3-99个)患者的分析,这些患者此前未检测到明显的APC种系突变。通过实时定量多重PCR技术检测APC外显子14缺失,发现缺失仅存在于典型息肉病患者中(7/60,12%),且多数缺失覆盖整个APC基因位点,表明单倍体不足可导致典型息肉病表型。该研究为APC突变阴性典型息肉病患者的基因筛查提供了依据,适用于遗传性结直肠癌、基因突变分析与疾病表型关联等研究方向。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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