家族性腺瘤性息肉病中隐性突变分析

该数据集基于单等位基因突变分析(MAMA)技术,提供了家族性腺瘤性息肉病(FAP)患者的基因表达与突变数据,主要包含APC基因等位基因状态、表达水平等遗传学信息,属于基因与临床表格模态数据,用于探究FAP的致病机制、评估APC基因突变在疾病中的贡献,并支持遗传病基因检测与相关新基因的发现研究。

National Academy of SciencesNational Academy of Sciences
PubMed Central
1999-03-02 更新
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遗传病致病机制基因突变检测

基本信息

创建/更新时间
1999-03-02

资源简介

该数据集聚焦于家族性腺瘤性息肉病(FAP),这是一种以结直肠数百个腺瘤性息肉为特征的常染色体显性遗传病。研究通过单等位基因突变分析(MAMA)技术,独立检测APC基因两个等位基因的状态,以探究约20%未发现APC基因截短突变的FAP患者的致病原因。数据包含对9名患者的分析结果,其中7名患者的一个等位基因表达显著降低,而2名患者两个等位基因均显示全长表达。研究结论表明,超过95%的FAP患者存在APC基因失活突变,结合MAMA与标准遗传测试可识别绝大多数患者的APC异常。数据集支持FAP可能涉及APC之外的其他基因,并反驳了APC突变需发挥显性负效应的假说,主要应用于遗传病致病机制研究与基因突变检测领域。

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https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC26782/

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数据说明

该数据集聚焦于家族性腺瘤性息肉病(FAP),这是一种以结直肠数百个腺瘤性息肉为特征的常染色体显性遗传病。研究通过单等位基因突变分析(MAMA)技术,独立检测APC基因两个等位基因的状态,以探究约20%未发现APC基因截短突变的FAP患者的致病原因。数据包含对9名患者的分析结果,其中7名患者的一个等位基因表达显著降低,而2名患者两个等位基因均显示全长表达。研究结论表明,超过95%的FAP患者存在APC基因失活突变,结合MAMA与标准遗传测试可识别绝大多数患者的APC异常。数据集支持FAP可能涉及APC之外的其他基因,并反驳了APC突变需发挥显性负效应的假说,主要应用于遗传病致病机制研究与基因突变检测领域。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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