PRJNA616100：人源原始序列读段

该数据集来自 NCBI，收录人源原始序列读段，对应贲门失弛缓症相关的 miRNA 表达谱研究。数据基于下一代测序（NGS）对贲门失弛缓症与非贲门失弛缓症患者的食管组织样本进行 miRNA 表达谱检测，可用于比较两组样本的 miRNA 表达差异，支撑贲门失弛缓症分子特征分析与分类建模（来源 ncbi.

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基因组分类Raw sequence reads

PRJNA616100: Homo sapiens Raw sequence reads

基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA616100：人源原始序列读段

PRJNA616100 是一个来自 NCBI 的人源原始序列读段数据集，对应贲门失弛缓症相关的 miRNA 表达谱研究。该研究基于下一代测序（NGS）技术，对贲门失弛缓症患者与非贲门失弛缓症患者的食管组织样本进行 miRNA 表达谱检测，数据以原始序列读段的形式收录。数据集在分类上归属于消化系统疾病中的贲门失弛缓症方向，主题标签为原始序列读段。整体来看，该数据集为比较两组样本之间的 miRNA 表达差异提供了原始测序数据基础，可用于贲门失弛缓症分子特征分析与分类建模等研究用途，数据来源为 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

贲门失弛缓症是一种累及食管动力功能的消化系统疾病。该数据集所对应的研究关注贲门失弛缓症在分子层面的表达特征，具体聚焦于 miRNA 表达谱。研究通过对食管组织样本进行下一代测序，获取 miRNA 表达信息，从而为理解贲门失弛缓症患者与非贲门失弛缓症患者之间的分子差异提供数据支撑。数据集英文名称为 PRJNA616100: Homo sapiens Raw sequence reads，表明其收录的是人源原始序列读段。

【数据内容】

该数据集的内容为人源原始序列读段，主题标签即为 Raw sequence reads。这些读段来源于对食管组织样本开展的 miRNA 表达谱检测，检测手段为下一代测序（NGS）。数据覆盖贲门失弛缓症患者与非贲门失弛缓症患者两类样本的 miRNA 表达谱信息，可用于比较两组样本的 miRNA 表达差异。除上述内容外，源站未提供关于样本数量、读段数量、测序平台型号、读段长度等更细粒度的数据描述。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。根据源站描述，miRNA 表达谱检测是在贲门失弛缓症与非贲门失弛缓症患者的食管组织样本上进行的，采用下一代测序（NGS）技术完成。数据集归属于消化系统疾病 / 贲门失弛缓症分类。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及测序服务的具体机构，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于贲门失弛缓症相关的 miRNA 表达差异比较研究，可支撑贲门失弛缓症的分子特征分析与分类建模。研究者可以基于原始序列读段开展 miRNA 表达谱的再分析，探索两组样本之间的表达差异模式。此外，该数据也可作为消化系统疾病分子机制研究中与贲门失弛缓症相关的数据资源使用。关于其他具体应用场景，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以原始序列读段形式提供，使用前通常需要经过读段质量控制、比对或注释等处理步骤，以获得 miRNA 表达信息。由于数据对应 miRNA 表达谱研究，分析时可围绕 miRNA 的表达定量与两组样本间的差异比较展开。关于源站是否提供配套的分析流程、预处理数据或表达矩阵，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为原始序列读段，未经过汇总或表达定量处理，使用者的分析结果会受到后续处理流程的影响。数据仅涉及贲门失弛缓症与非贲门失弛缓症患者的食管组织样本的 miRNA 表达谱检测，研究结论的适用范围应结合这一设计加以考虑。关于数据质量评估指标、样本量、批次信息及潜在偏倚等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，使用时应遵循源站的引用要求与数据使用政策。关于具体的引用文献、作者信息以及许可条款，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA616100

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA616100

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

通过下一代测序（NGS）对贲门失弛缓症和非贲门失弛缓症患者的食管组织样本进行了miRNA表达谱分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别