基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

酒精使用障碍患者治疗前后纵向肠道微生物组变化

该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项生物学研究项目，英文名称为“PRJNA1450313: Longitudinal gut microbiome changes before and after treatment in patients with alcohol use disorder”，源站标题为“ID 1450313 - BioProject - NCBI”。其主题聚焦于酒精使用障碍患者在接受治疗前后的纵向肠道微生物组变化，所涉及的数据类型为原始测序读段（Raw sequence reads）。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的记录形式，通常来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集在本站被归类为“化学诱发性障碍 / 其他”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集可用于了解酒精使用障碍治疗过程中肠道微生物组的动态变化，并以原始测序读段作为核心数据内容。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1450313。BioProject 的定位是围绕单一研究计划或倡议，汇集由单一组织或联合体产生的生物数据，并为用户提供统一入口，以链接到该项目所生成的不同数据类型。该项目的主题为酒精使用障碍患者治疗前后的纵向肠道微生物组变化，属于与酒精使用障碍相关的微生物组研究。本站将其分类为“化学诱发性障碍 / 其他”，主题标签为“Raw sequence reads”。源站未提供该项目的具体研究机构、资助来源、研究起止时间以及更详细的研究背景说明。

【数据内容】

该数据集的核心数据内容为原始测序读段（Raw sequence reads），对应酒精使用障碍患者治疗前后肠道微生物组变化的纵向研究。由于主题涉及“治疗前后”的纵向比较，其数据在概念上应包含不同时间点的微生物组测序信息，但源站未提供样本数量、时间点数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体细节。除原始测序读段外，源站未提供其他数据类型或衍生分析结果的说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录于 NCBI BioProject 数据库，项目 ID 为 1450313。BioProject 记录本身并不一定直接包含所有原始数据文件，而是提供指向该项目所产生多种数据类型的链接入口。源站未提供样本采集地点、采集时间、受试者招募方式、伦理审批信息、治疗方式细节以及测序实验的具体流程。因此，关于样本如何采集、在何种临床环境下获得、以及测序由哪个机构完成等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与酒精使用障碍相关的肠道微生物组研究场景，尤其是关注治疗前后微生物组纵向变化的研究。原始测序读段可用于微生物组组成分析、多样性分析、差异丰度分析等下游处理，也可作为同类研究的参考数据或用于方法学比较。由于本站分类为“化学诱发性障碍 / 其他”，该数据也可能在更广泛的物质使用障碍与微生物组交互研究中作为数据资源使用。但具体适用性取决于研究者对原始测序读段的质量评估和实验设计理解，源站未提供针对特定分析场景的推荐或验证结论。

【使用方法】

使用者通常需要通过 NCBI BioProject 记录入口，查找该项目所链接的原始测序读段及相关数据资源，并根据项目提供的数据类型进行下载和后续分析。由于 BioProject 提供的是统一入口，用户可据此定位到与该研究计划相关的不同数据资源。原始测序读段一般需要经过质量控制、比对或组装、物种注释等生物信息学流程后，才能用于微生物组组成与变化分析。源站未提供具体的下载步骤、数据处理流程、推荐工具或分析参数，因此实际使用方法需结合 NCBI 平台的一般使用方式和研究者自身分析需求确定。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录，提供的是项目层面的数据入口，而非经过统一质量评估的最终分析结果。原始测序读段的质量取决于原始实验与测序过程，源站未提供质量评分、污染评估、批次效应说明或数据完整性验证信息。此外，源站未提供样本量、临床信息、治疗细节、时间点设计等关键元数据，这可能限制对纵向变化进行深入解释。该数据集的主题涉及酒精使用障碍患者，相关数据的使用还需考虑伦理、隐私和临床数据保护要求。源站未提供具体的质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集的引用方式应遵循 NCBI BioProject 的通用引用规范，并指向项目 ID 1450313 及对应英文名称。源站未提供该数据集的具体许可条款、使用限制、授权要求或商业使用规定。使用者在使用原始测序读段及相关数据时，应自行查阅 NCBI 平台及项目页面所附的许可与使用政策。源站未提供引用格式示例、许可类型或数据共享限制的详细说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1450313

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1450313

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目研究酒精使用障碍（AUD）患者在治疗前后肠道微生物组的纵向变化。在基线时及治疗后的随访时间点收集粪便样本。利用16S rRNA基因扩增子测序对微生物群落图谱进行表征。本研究旨在识别与酒精暴露、戒酒及治疗反应相关的微生物组改变。纵向配对采样能够评估个体内微生物组随时间的动态变化。该数据集为了解AUD中的微生物组变化及其在疾病进展和康复中的潜在作用提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别