phs000393:人类尼古丁依赖相关基因

数据以 Case Set 与 Case-Control 设计组织,属于化学诱发性障碍/其他分类。可用于研究尼古丁依赖的遗传易感性,支持病例与对照之间的分类建模与关联分析,帮助识别与尼古丁依赖相关的候选基因(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set, Case-Control
phs000393: Genes Contributing to Nicotine Dependence in Humans

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

phs000393:人类尼古丁依赖相关基因

phs000393 是一个以人类尼古丁依赖遗传易感性为核心研究目标的数据集,英文全称为 Genes Contributing to Nicotine Dependence in Humans。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究,采用 Case Set 与 Case-Control 两种设计形式组织数据。在分类上,它被归入化学诱发性障碍 / 其他类别,主题标签同样指向 Case Set 与 Case-Control。整体来看,该数据集围绕尼古丁依赖这一化学诱发性障碍,提供病例集合与病例-对照结构的数据资源,可用于探索遗传因素在尼古丁依赖形成中的作用,支持病例与对照之间的分类建模与关联分析,并帮助识别与尼古丁依赖相关的候选基因。

【数据集背景】

该数据集聚焦于人类尼古丁依赖的遗传基础研究。尼古丁依赖属于化学诱发性障碍范畴,其形成通常涉及遗传易感性与环境因素的共同作用。phs000393 以“Genes Contributing to Nicotine Dependence in Humans”为题,明确指向寻找贡献于人类尼古丁依赖的基因。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究体系下的资源。该研究采用 Case Set 与 Case-Control 设计,意味着数据组织上包含病例集合以及病例与对照的对比结构,适合从遗传变异角度考察尼古丁依赖相关表型的分布差异。该数据集在分类上被置于化学诱发性障碍 / 其他,主题标签为 Case Set 与 Case-Control,这些信息共同界定了其在遗传流行病学与行为遗传学研究中的基本定位。

【数据内容】

数据以 Case Set 与 Case-Control 设计组织。Case Set 通常指一组具有特定表型或状态的样本集合,而 Case-Control 则强调病例组与对照组之间的比较结构。该数据集的主题标签同样为 Case Set 与 Case-Control,说明其核心内容围绕这两类设计展开。源站描述为 dbGaP study (Case Set, Case-Control),进一步确认了其数据组织方式。该数据集可用于研究尼古丁依赖的遗传易感性,支持病例与对照之间的分类建模与关联分析,帮助识别与尼古丁依赖相关的候选基因。关于具体的样本量、遗传标记数量、表型测量细节、测序或基因分型平台等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。源站描述明确其为 dbGaP study,并标注了 Case Set 与 Case-Control 两种设计。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息、知情同意过程等具体采集细节,源站未提供。该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,这一来源表明其属于公共数据库中的研究资源,但关于数据提交者、研究机构、资助来源等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究尼古丁依赖的遗传易感性。具体而言,可用于病例与对照之间的分类建模与关联分析,帮助识别与尼古丁依赖相关的候选基因。由于采用 Case Set 与 Case-Control 设计,该数据集适合开展遗传关联研究,比较病例组与对照组在遗传变异频率上的差异,进而探索哪些基因或变异可能增加或降低尼古丁依赖的风险。此外,该数据集也可用于方法学层面的分类建模研究,例如构建预测模型以区分病例与对照状态。该数据集属于化学诱发性障碍 / 其他分类,因此其适用场景也涵盖化学诱发性障碍领域内与遗传易感性相关的研究。关于是否适用于其他特定分析类型,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 Case Set 与 Case-Control 设计组织,使用者可根据研究目的提取病例集合或病例-对照数据,开展遗传关联分析或分类建模。由于来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,且属于 dbGaP 研究,通常需要通过相应数据库的访问流程获取数据。关于具体的下载方式、数据格式、访问权限申请步骤、所需审批条件、数据分析工具推荐等,源站未提供。使用者应依据 ncbi.nlm.nih.gov 上该研究对应的 dbGaP 页面所载明的访问规则进行操作。关于数据预处理、质量控制、统计模型选择等具体方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究,采用 Case Set 与 Case-Control 设计。关于样本量大小、数据完整性、基因分型或测序质量、群体分层控制、重复样本处理、缺失值比例等质量指标,源站未提供。该数据集在分类上属于化学诱发性障碍 / 其他,主题标签为 Case Set 与 Case-Control,这些信息可用于判断其设计类型,但不足以评估其具体质量水平。使用者在开展关联分析或分类建模时,应注意病例与对照的定义、样本来源的异质性以及潜在混杂因素,但关于该数据集是否存在特定限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集英文名为 phs000393: Genes Contributing to Nicotine Dependence in Humans,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。关于引用格式、许可条款、使用限制、数据共享协议、商业用途规定等具体信息,源站未提供。使用者应参考 ncbi.nlm.nih.gov 上该研究对应的 dbGaP 页面所载明的引用与许可要求。关于是否需要获得额外授权或遵守特定数据使用协议,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000393

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set, Case-Control).

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