NCI 非霍奇金淋巴瘤 GWAS:MZL

该数据集为 dbGaP 收录的 NCI 非霍奇金淋巴瘤 GWAS 研究中的 MZL 部分,属于病例集与病例对照设计。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,本站归类为肿瘤 / 淋巴瘤

dbgap
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基因组分类Case Set, Case-Control
phs000891: NCI Non-Hodgkin Lymphoma GWAS: MZL

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

NCI 非霍奇金淋巴瘤 GWAS:MZL

phs000891: NCI Non-Hodgkin Lymphoma GWAS: MZL 是 dbGaP 收录的一项与非霍奇金淋巴瘤相关的全基因组关联研究数据,具体聚焦于 MZL 这一亚型。该数据集在来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上被标注为 dbGaP study,研究设计涉及病例集与病例对照两种类型。在本站,它被归类于肿瘤 / 淋巴瘤方向,主题标签同样指向病例集与病例对照。整体来看,该资源属于遗传关联研究范畴,可用于探索非霍奇金淋巴瘤中 MZL 亚型与遗传变异之间的潜在关联,为后续的统计遗传学分析和候选位点研究提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来自 NCI 非霍奇金淋巴瘤 GWAS 研究项目,英文全称为 phs000891: NCI Non-Hodgkin Lymphoma GWAS: MZL。非霍奇金淋巴瘤是一组异质性较强的淋巴系统恶性肿瘤,MZL 是其重要亚型之一。通过全基因组关联研究策略,研究者试图从全基因组层面寻找与 MZL 易感性相关的遗传标记。该数据集作为 dbGaP 收录的研究资源,体现了以病例集和病例对照设计为基础的遗传关联研究思路。关于该研究的具体立项背景、研究假设、参与机构及研究起止时间,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容围绕 NCI 非霍奇金淋巴瘤 GWAS 中的 MZL 部分展开。根据来源站描述,其研究类型为 dbGaP study,设计类型包括 Case Set 与 Case-Control。这意味着数据可能包含 MZL 病例样本以及相应的对照样本,用于比较两组之间在基因组变异频率上的差异。主题标签同样标注为 Case Set 和 Case-Control,进一步明确了其病例集与病例对照属性。关于样本量、变异位点数量、测序或基因分型平台、原始数据文件类型、临床变量字段等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 数据库收录的研究。dbGaP 是美国国家生物技术信息中心维护的基因型与表型数据库,常用于存储和分发受控访问的遗传研究数据。该数据集在来源站被描述为 dbGaP study,研究设计标注为 Case Set 与 Case-Control。本站将其归类为肿瘤 / 淋巴瘤,主题标签为 Case Set 与 Case-Control。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息以及数据提交的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例集与病例对照设计,该数据集适用于探索 MZL 与其他非霍奇金淋巴瘤亚型或健康对照之间的遗传差异。潜在应用包括全基因组关联分析的重复验证、候选基因或候选区域的关联检验、遗传易感性位点的筛选以及多数据集联合分析中的组成部分。由于该数据聚焦于 MZL 亚型,也可用于亚型特异性遗传架构的比较研究。关于该数据集是否已被用于特定发表成果、是否适合特定统计模型或是否支持特定表型分析,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,通常需要通过 dbGaP 的受控访问流程申请获取。研究者一般需提交数据使用申请,获得批准后方可下载和分析。分析时可根据病例对照设计进行关联分析、群体分层校正、基因型质控以及荟萃分析等。关于该数据集的具体访问级别、申请条件、下载格式、配套分析工具或推荐流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被标注为 dbGaP study,设计类型为病例集与病例对照,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于样本质量、基因型 calling 准确率、缺失率、群体分层程度、对照匹配情况以及可能的批次效应,源站未提供。由于 MZL 属于相对少见的亚型,样本量可能构成分析效能上的限制,但具体样本规模源站未提供。使用时应关注病例对照设计的固有局限,如选择偏倚和混杂因素,但相关具体信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,属于受控访问研究资源。使用时应遵循 dbGaP 的数据使用协议和相关许可要求。关于该数据集的具体引用格式、文献出处、数据生产者名单、许可类型以及二次分发规定,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000891

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set, Case-Control).

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