MIMIC扩展药物检测

该项目提供了一个来自 MIMIC-III/IV 的多标签标注临床记录句子数据集,用于物质使用检测。它支持用于识别患者病历中各种共现药物使用提及的自然语言处理研究

physionet
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文本分类临床笔记电子病历物质使用成瘾医学多标签分类文本分类提及识别自然语言处理
MIMIC-Ext-DrugDetection

基本信息

模态
文本
任务类型
分类
许可
PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
创建/更新时间
2026-10-01
版本
1.0.0

资源简介

MIMIC扩展药物检测

该项目提供了一个来自 MIMIC-III/IV 的多标签标注临床记录句子数据集,用于物质使用检测。它支持用于识别患者病历中各种共现药物使用提及的自然语言处理研究

mimic-ext-drug-detection

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MIMIC-Ext-DrugDetection》。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该项目提供了一个来自 MIMIC-III/IV 的多标签标注临床记录句子数据集,用于物质使用检测。它支持用于识别患者病历中各种共现药物使用提及的自然语言处理研究。

【主题与分类】

主题标签:临床笔记、电子病历、物质使用、成瘾医学、多标签分类、文本分类、提及识别、自然语言处理。本站分类:化学诱发性障碍/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://physionet.org/content/mimic-ext-drug-detection/

使用许可:PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0。

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使用方式

数据集获取(PhysioNet)

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  1. 在 https://physionet.org/content/mimic-ext-drug-detection/1.0.0 页面登录并接受许可条款;
  2. 命令行整目录下载:
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/mimic-ext-drug-detection/1.0.0/
  1. 或用官方工具(推荐,支持断点续传与校验):
pip install physionet-download
physionet-download mimic-ext-drug-detection

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

本项目共享了一个基于 MIMIC-III/IV 出院小结创建的大型、带标注的药物检测数据集。该数据集旨在应对在电子健康记录(EHRs)中识别物质使用行为的挑战,因为其中的关键细节往往嵌入在需要结合上下文解读的非结构化笔记中。主要目标是支持未来的系统性物质使用监测。数据由切分为句子的医疗笔记组成,并针对八类物质使用类别进行了标注:海洛因、可卡因、甲基苯丙胺、处方阿片类药物和苯二氮䓬类药物的非法使用、大麻、注射吸毒(IDU)以及一般药物使用。该数据集被用于评估各种大型语言模型(LLMs)检测这些物质使用类别的性能,表明 LLMs,尤其是经过微调的模型,可以显著提高检测准确性,并在临床决策支持和研究中展现出前景。

许可

PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0

引用

学术使用请引用:Harel-Canada et al. (2025). MIMIC-Ext-DrugDetection. PhysioNet. doi:10.13026/0kyx-r485 DOI 10.13026/0kyx-r485。

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