Deepwater Horizon原油暴露改变鲯鳅幼鱼胆固醇生物合成数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/R6-x804-000-0030-0001

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

以往研究预测，鲯鳅仔鱼的胆固醇生物合成途径可能受到原油暴露的影响。本项目旨在确定该途径中量化的基因表达变化是否会导致仔鱼胆固醇发生变化。鲯鳅仔鱼暴露于不同亚致死浓度的浮油和源油中。采用酶联吸光度测定法定量仔鱼中的胆固醇，并使用免疫组织化学方法可视化胆固醇浓度和分布的变化。此外，还获取了水质数据。该数据集支持以下出版物：McGruer, V., Pasparakis, C., Grosell, M., Stieglitz, J. D., Benetti, D. D., Greer, J. B., & Schlenk, D. (2019). Deepwater Horizon crude oil exposure alters cholesterol biosynthesis with implications for developmental cardiotoxicity in larval mahi-mahi (Coryphaena hippurus). Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology, 220, 31–35. doi:10.1016/j.cbpc.2019.03.001

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。