基于rs2856650、rs3740689和rs10769258的单倍型与静脉血栓风险关联的GWAS数据集
该数据集是一个基于两项全基因组关联研究(GWAS)的元分析数据集,主要包含由rs2856650、rs3740689和rs10769258三个SNP位点构成的单倍型的个体基因型数据、频率分布及统计分析结果,数据模态为基因型数据和临床关联统计表,主要用于研究特定遗传单倍型与静脉血栓形成(VT)风险的关联,服务于心血管疾病遗传机制、血栓形成易感性和精准医疗等研究方向。

基本信息
资源简介
基于rs2856650、rs3740689和rs10769258的单倍型与静脉血栓风险关联的GWAS数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Association of haplotypes derived from rs2856650, rs3740689 and rs10769258 with VT risk in two GWAS.》。源站首次发布:2012-06-04。
【数据内容】
源站原始描述:The meta-analysis of the AGT haplotype-associated ORs obtained in the two GWAS samples lead to an overall OR of 2.78 [2.01–3.81] (p = 4.72 10−10). In a combined analysis of the individual-level genotype data of the two GWAS, the AGT haplotype frequency was estimated to 0.054 and 0.019 in cases and controls, respectively. This led to a combined OR of 3.03 [2.23–4.10] (p = 8.96 10−13) compared to the most frequent GGT haplotype (with estimated frequency 0.330 and 0.343 in cases and controls, respe…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 9.73 KB。Table_2.xls:application/vnd.ms-excel,9.73 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0038538.t002。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences、Genetics、Hematology。主题标签:haplotypes、derived、rs3740689、rs10769258、vt。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Genetics、Hematology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Association_of_haplotypes_derived_from_rs2856650_rs3740689_and_rs10769258_with_VT_risk_in_two_GWAS_/299873
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Germain, Marine; Saut, Noémie; Oudot-Mellakh, Tiphaine; Letenneur, Luc; Dupuy, Anne-Marie; Bertrand, Marion; et al. (2015). Association of haplotypes derived from rs2856650, rs3740689 and rs10769258 with VT risk in two GWAS.. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
本数据集是一个关于静脉血栓形成(VT)遗传易感性的全基因组关联研究(GWAS)元分析数据集。数据来源于两项独立的GWAS研究,聚焦于rs2856650、rs3740689和rs10769258三个单核苷酸多态性(SNP)位点构成的单倍型(特别是AGT单倍型)与VT风险的关联性分析。数据集包含个体水平的基因型数据、单倍型频率估计、风险比值比(OR)及其置信区间等统计结果。通过元分析和联合分析,该研究证实了特定单倍型(如AGT)与VT风险的显著关联,主要应用于心血管疾病、血栓形成遗传机制、精准医学和遗传流行病学等研究领域。
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