结节病祖先连锁基因组区域内的峰值等位基因关联及相应MIX评分结果
该数据集提供了结节病遗传关联分析的核心结果,包含等位基因频率、优势比、置信区间和p值等统计指标,数据模态为基因型与统计表格,主要应用于研究结节病的遗传易感性、祖先背景对疾病关联的影响,以及通过MIX评分检验进行精细遗传定位。

基本信息
资源简介
结节病祖先连锁基因组区域内的峰值等位基因关联及相应MIX评分结果
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Peak allelic associations within genomic regions of sarcoidosis ancestry linkage after adjustment for both global and local West African ancestry and corresponding MIX score results.》。配套论文《Admixture Fine-Mapping in African Americans Implicates XAF1 as a Possible Sarcoidosis Risk Gene》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0092646。源站首次发布:2014-03-24。
【数据内容】
源站原始描述:Abbreviations: fCEU: frequency of modeled allele in HapMap Northern and Western European ancestry population; fAFR: frequency of modeled allele in HapMap Yoruban African ancestry population; fAFF: frequency of modeled allele in sarcoidosis-affected individuals; fUNF: frequency of modeled allele in unaffected individuals; OR: odds ratio; 95%CI: 95% confidence interval; P: p-value; MIX: MIXSCORE test. 1Minor allele in African Americans is bolded; modeled by generalized estimating equations adjusti…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 5.63 KB。Table_1.xls:application/vnd.ms-excel,5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0092646.t001。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:Computational biology、Evolutionary biology、population genetics、Genetic polymorphism、haplotypes、genetics、Human genetics、Genetic association studies、gene expression、Gene function。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Peak_allelic_associations_within_genomic_regions_of_sarcoidosis_ancestry_linkage_after_adjustment_for_both_global_and_local_West_African_ancestry_and_corresponding_MIX_score_results_/971982
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:M. Levin, Albert; C. Iannuzzi, Michael; G. Montgomery, Courtney; Trudeau, Sheri; Datta, Indrani; Adrianto, Indra; et al. (2015). Peak allelic associations within genomic regions of sarcoidosis ancestry linkage after adjustment for both global and local West African ancestry and corresponding MIX sco…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含结节病(sarcoidosis)遗传关联分析的结果,主要聚焦于在调整全球和局部西非祖先背景后,基因组区域内峰值等位基因的关联统计信息。数据内容包括等位基因频率(在HapMap欧洲人群、非洲人群、结节病患者及未患病个体中的频率)、优势比(OR)、95%置信区间、p值以及MIXSCORE检验结果。数据来源于对非裔美国人群体进行的遗传研究,部分单核苷酸多态性(SNP)为基因型插补得到,插补准确度较高(如rs62158012为98.7%)。该数据集主要用于结节病的遗传易感性研究、祖先特异性遗传关联分析以及复杂疾病遗传机制的探索。
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