人静脉曲张细胞外基质分析数据集
主题标签:静脉曲张、细胞外基质、心血管系统疾病、蛋白质组学。本站分类:心血管系统疾病/静脉曲张。本数据集为心血管系统疾病领域公开数据集,主题涵盖静脉曲张。

基本信息
资源简介
人静脉曲张细胞外基质分析数据集
Extracellular Matrix Analysis of Human Varicose Veins 是一个聚焦于人类静脉曲张细胞外基质研究的公开蛋白质组学数据集,归属于心血管系统疾病领域下的静脉曲张方向,数据托管于欧洲生物信息研究所(EBI)的 PRIDE 归档平台。该数据集以静脉曲张、细胞外基质、心血管系统疾病和蛋白质组学为核心主题标签,面向心血管基础研究与静脉疾病机制探索提供数据支撑。数据集由 Xiaoke Yin 于 2016 年发布,项目编号为 PXD002555,可通过 EBI PRIDE 归档的项目页面获取。整体而言,该数据集围绕人类静脉曲张样本的细胞外基质分析展开,属于心血管系统疾病领域公开可用的科研数据资源,适合作为静脉曲张相关蛋白质组学研究的参考数据。
【数据集背景】
静脉曲张是心血管系统疾病中常见的静脉疾病,其发生发展与静脉壁结构改变密切相关,而细胞外基质作为构成血管壁的重要成分,在维持血管结构与力学性能方面具有关键作用。对该疾病背景下细胞外基质的研究,有助于从分子层面理解静脉壁重塑的过程。该数据集正是在这一研究背景下产生,以人类静脉曲张样本为对象,采用蛋白质组学手段对细胞外基质进行分析,主题涵盖静脉曲张、细胞外基质、心血管系统疾病与蛋白质组学等方面,为静脉曲张的机制研究提供数据基础。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括静脉曲张、细胞外基质、心血管系统疾病与蛋白质组学,表明其内容围绕人类静脉曲张样本中细胞外基质相关的蛋白质组学分析展开。数据集归属于心血管系统疾病 / 静脉曲张分类,属于该领域内的公开数据集。关于数据集内具体包含的样本数量、蛋白鉴定数目、定量结果或文件构成等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,托管于 EBI 的 PRIDE 归档平台,项目访问编号为 PXD002555。数据由 Xiaoke Yin 于 2016 年发布,引用信息为 Xiaoke Yin (2016). Extracellular Matrix Analysis of Human Varicose Veins [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002555。关于样本采集的具体流程、实验设计、仪器平台与数据处理方法等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病领域特别是静脉曲张方向的研究工作,可服务于细胞外基质相关蛋白质组学的分析需求。其主题覆盖静脉曲张与细胞外基质,适合用于静脉疾病机制探索、静脉壁细胞外基质成分研究等场景,也可作为蛋白质组学数据再利用与比较分析的参考资源。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为公开数据集,可通过 EBI PRIDE 归档平台的项目页面(https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002555)访问。关于数据下载方式、文件格式说明、分析流程与使用条件等具体操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 EBI PRIDE 归档平台收录的公开数据集,具有明确的发布者、发布年份与项目编号信息。关于数据质量评估指标、样本规模、技术重复情况以及数据使用的具体限制,源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时,应引用 Xiaoke Yin (2016). Extracellular Matrix Analysis of Human Varicose Veins [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002555。关于该数据集的许可条款与使用授权信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002555
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Xiaoke Yin (2016). Extracellular Matrix Analysis of Human Varicose Veins [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD002555
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




