系统性红斑狼疮与肺动脉高压的遗传关联研究数据集

该数据集基于全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,包含与系统性红斑狼疮(SLE)和肺动脉高压(PAH)相关的单核苷酸多态性(SNP)位点、风险SNP、潜在药物靶点基因以及组织特异性富集分析结果,数据模态主要为遗传变异和基因表达信息,主要用于研究两种疾病之间的遗传关联、共享机制及潜在治疗靶点,为自身免疫性疾病与心血管疾病的共病机制探索提供遗传学依据。

Qi.Deng; Jianhui.Tang; Han.Wang; Yinli.Wang; Dimao.QinQi.Deng; Jianhui.Tang; Han.Wang; Yinli.Wang; Dimao.Qin
科学数据银行
2025-05-21 更新
浏览 26
Genetic associations between systemic lupus erythematosus and pulmonary arterial hypertension

基本信息

创建/更新时间
2025-05-21

资源简介

该数据集基于大规模全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,旨在探索系统性红斑狼疮(SLE)与肺动脉高压(PAH)之间的遗传相关性、共享遗传结构及潜在机制。数据内容包括:通过交叉性状分析识别出的113个可能与SLE和PAH均相关的SNP位点;基于FUMA确定的14个与两种疾病相关的风险SNP;通过SMR分析发现的27个重叠的潜在药物靶点基因;以及通过分层LD评分回归(S-LDSC)和FUMA进行的组织特异性富集分析结果(如皮肤、全血、肝脏等组织中的SNP富集,以及全血、脑组织、成纤维细胞和脾脏中的基因富集)。该数据集主要用于研究自身免疫性疾病与心血管疾病之间的共同遗传基础,为理解疾病共病机制和发现新的治疗靶点提供遗传学证据。

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源站:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=OA_af8b1f23e2814e4aab7044ce3c3da295

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集基于大规模全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据,旨在探索系统性红斑狼疮(SLE)与肺动脉高压(PAH)之间的遗传相关性、共享遗传结构及潜在机制。数据内容包括:通过交叉性状分析识别出的113个可能与SLE和PAH均相关的SNP位点;基于FUMA确定的14个与两种疾病相关的风险SNP;通过SMR分析发现的27个重叠的潜在药物靶点基因;以及通过分层LD评分回归(S-LDSC)和FUMA进行的组织特异性富集分析结果(如皮肤、全血、肝脏等组织中的SNP富集,以及全血、脑组织、成纤维细胞和脾脏中的基因富集)。该数据集主要用于研究自身免疫性疾病与心血管疾病之间的共同遗传基础,为理解疾病共病机制和发现新的治疗靶点提供遗传学证据。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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