人类动脉导管平滑肌细胞 (hDASMC) 综合转录组
该数据集包含人类动脉导管平滑肌细胞在缺氧和常氧条件下的转录组数据，通过3' RNA测序技术获取，涉及基因表达谱和细胞反应模态，主要用于研究动脉导管闭合的分子机制、氧诱导的细胞信号通路，以及先天性心脏病如动脉导管未闭的病理生理基础，为心血管发育和疾病治疗提供关键见解。
基本信息
资源简介
人类动脉导管平滑肌细胞 (hDASMC) 综合转录组
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The comprehensive transcriptome of human ductus arteriosus smooth muscle cells (hDASMC)》。源站首次发布：2021-12-15。
【数据内容】
源站原始描述：The Ductus Arteriosus (DA) is a fetal vessel that connects the aorta to the pulmonary artery ensuring that placental oxygenated blood is diverted from the lungs to the systemic circulation. Following exposure to oxygen (O2), in the first few days of life, the DA responds with a functional closure that is followed by anatomical closure. Here, we study human DA smooth muscle cells (DASMC) taken from 10 term infants during congenital heart surgery. Purification of these cells using flow cytometry e…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 6.15 MB。数据集 DOI：10.17632/z42wpkbb8k.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/z42wpkbb8k
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/z42wpkbb8k
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个医学研究数据集，专注于人类动脉导管平滑肌细胞（hDASMC）的转录组分析。动脉导管是连接主动脉和肺动脉的胎儿血管，负责将胎盘氧合血从肺部分流至体循环。数据集包含从10名足月婴儿先天性心脏病手术中获取的hDASMC样本，通过流式细胞术纯化以确保细胞纯度，并验证了细胞对氧的反应性（如氧诱导的细胞内钙增加和细胞收缩）。细胞在缺氧（2.5% O2，模拟子宫内条件）和常氧（19% O2，模拟新生儿条件）两种环境下培养，随后使用3’’ RNA测序技术获取转录组数据。该数据集主要用于研究动脉导管闭合的分子机制、氧诱导的细胞反应，以及先天性心脏病如动脉导管未闭（PDA）的病理生理基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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