GSE109722：小鼠马凡综合征数据集
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Marfan syndrome in mice，聚焦心血管系统疾病中的马凡综合征
基本信息
资源简介
GSE109722：小鼠马凡综合征数据集
GSE109722 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集，标题为“Marfan syndrome in mice”，中文可译为“小鼠马凡综合征”。该数据集归属于心血管系统疾病中的马凡综合征方向，其核心内容是通过全基因组表达谱比较，刻画 fibrillin-1 亚效等位基因小鼠（Fbn1mgR/mgR）在胸主动脉瘤发展过程中的基因表达特征。数据集以高通量测序进行表达谱分析，物种为小鼠（分类编号 10090），平台编号为 GPL21103。数据集仅包含一个文件，即 GSE109722_series_matrix.txt.gz，以 GZIP 压缩格式提供，便于下载后进行本地读取与分析。整体而言，该数据集面向马凡综合征相关胸主动脉瘤的分子机制研究，适合需要考察疾病进展过程中转录组变化的科研人员使用。
【数据集背景】
马凡综合征是一种累及结缔组织的遗传性疾病，其心血管系统表现尤为突出，胸主动脉瘤是其中重要的临床问题。该数据集正是围绕这一背景构建，利用 fibrillin-1 亚效等位基因小鼠模型（Fbn1mgR/mgR），比较全基因组表达谱，以刻画胸主动脉瘤发展过程中的基因表达变化。源站描述明确指出，其目的是通过全基因组表达谱比较来表征该模型小鼠在胸主动脉瘤发展期间的基因表达特征。这为研究马凡综合征相关主动脉病变的分子基础提供了转录组层面的数据支撑。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”，表明其数据来源于高通量测序的表达谱分析；平台编号为 GPL21103，物种分类编号为 10090，对应小鼠。数据集文件数量为 1，文件样例为 GSE109722_series_matrix.txt.gz，即一个经过 GZIP 压缩的系列矩阵文件。该文件通常承载样本层面的表达矩阵信息，是后续分析的主要数据载体。数据集中具体的样本数量、分组设计、测序深度、基因数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库，标题为“Marfan syndrome in mice”。作者为 Josephine、Galatioto，发布时间为 Jan 26 201（原文如此）。数据通过高通量测序对小鼠模型进行表达谱采集，聚焦于胸主动脉瘤发展过程中的全基因组表达变化。关于具体的实验组织取材、时间点设置、测序平台型号及建库方法等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心血管系统疾病尤其是马凡综合征及胸主动脉瘤相关的转录组研究。研究者可将其用于比较疾病发展过程中的基因表达谱变化，识别差异表达基因，探索胸主动脉瘤进展的分子特征；也可作为小鼠模型表达谱数据的参考，用于与其它主动脉疾病或结缔组织疾病数据集进行对照分析。此外，对于关注 fibrillin-1 功能缺陷所引发表达改变的研究，该数据集具有直接的参考价值。具体可支持的统计分析方法与结论范围，需结合数据实际内容判断，源站未提供进一步说明。
【使用方法】
使用该数据集时，首先下载数据文件 GSE109722_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，需先解压再按文本格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因编码或字段解析问题导致分析偏差。读取后可依据系列矩阵中的样本与表达信息开展后续分析。关于矩阵文件的具体字段含义、注释信息及配套分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含一个系列矩阵文件，未提供原始测序数据或其它辅助文件的说明，源站未提供关于数据完整性、测序质量、批次效应等方面的评估信息。样本数量、生物学重复情况、数据标准化方法等影响分析可靠性的关键细节，源站未提供。因此在使用时应谨慎解读结果，必要时应结合原始数据或其它独立数据集进行验证。数据发布时间标注为 Jan 26 201，年份信息不完整，源站未提供更明确的说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Josephine、Galatioto，来源为 NCBI GEO。关于该数据集的具体引用格式、发表文献、使用许可及再分发条件，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应自行查阅源站页面以获取准确的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE109722
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Comparison of whole genome expression profiles to characterize gene expression during development of thoracic aortic aneurysm in fibrillin-1 hypomorphic mice (Fbn1mgR/mgR).
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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