人离体右心房组织的转录组与空间解析揭示缺血性心脏病中的促炎微血管变化
该数据集来自 CAREBANK 与 PERIHEART 两项研究，纳入在 Turku University Hospital 和 Kuopio University Hospital 接受心脏直视手术的患者，采集右心房耳部组织，采用 10x 3' v3 进行单细胞转录组检测，并包含空间解析信息
基本信息
资源简介
人离体右心房组织的转录组与空间解析揭示缺血性心脏病中的促炎微血管变化
该数据集来自 CAREBANK 与 PERIHEART 两项研究，纳入在 Turku University Hospital 和 Kuopio University Hospital 接受心脏直视手术的患者，采集右心房耳部组织，采用 10x 3' v3 进行单细胞转录组检测，并包含空间解析信息。数据覆盖冠状动脉疾病、心力衰竭、心脏瓣膜病、心肌梗死、心肌缺血及正常样本，可用于比较缺血性心脏病与正常心脏微血管的促炎变化，支持细胞类型注释、差异表达分析及微血管相关机制研究（来源 cellxgene.cziscience.com）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：CAREBANK 研究自 2016 年 2 月起在 Turku University Hospital 招募接受心脏直视手术（冠状动脉搭桥手术、瓣膜性心脏病手术和升主动脉手术）的患者，PERIHEART 研究自 2012 年起在 Kuopio University Hospital 招募患者。所有患者在手术前均签署书面知情同意书。疾病：冠状动脉疾病、心力衰竭、心脏瓣膜病、心肌梗死、心肌缺血、正常。组织：右心房耳部区域。检测方法：10x 3' v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
【主题与分类】
主题标签：coronary artery disorder、heart failure、heart valve disorder、myocardial infarction、myocardial ischemia、normal。本站分类：循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面：https://cellxgene.cziscience.com/collections/8c782494-01ed-491b-97b9-6f0d3b76c676
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数据集获取
源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/8c782494-01ed-491b-97b9-6f0d3b76c676
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
CAREBANK研究自2016年2月起在Turku大学医院招募了接受心脏直视手术（冠状动脉搭桥手术、瓣膜性心脏病手术和升主动脉手术）的患者，而PERIHEART研究自2012年起在Kuopio大学医院进行。所有患者在手术前均提供了书面知情同意。疾病：冠状动脉疾病、心力衰竭、心脏瓣膜病、心肌梗死、心肌缺血、正常。组织：右心房耳区。检测：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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