基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJEB113868：压力超负荷诱导心力衰竭大鼠模型左心室心肌转录组图谱

PRJEB113868 是一个聚焦于压力超负荷诱导心力衰竭的大鼠左心室心肌转录组数据集，来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集通过对接受 transverse aortic constriction（TAC）诱导心力衰竭的大鼠以及假手术对照进行左心室心肌转录组分析，旨在研究压力超负荷诱导心脏重构过程中相关的基因表达变化。数据集被用于探索心力衰竭中新的分子靶点，涉及 G 蛋白偶联受体（GPCR）相关通路以及 microRNA 调控的靶点网络。在分类上，该数据集归属于循环系统疾病下的心力衰竭方向，主题标签为 Other。整体而言，该数据集为理解压力超负荷条件下左心室心肌的转录组改变提供了研究材料，可用于心力衰竭分子机制与潜在靶点的探索性研究。

【数据集背景】

心力衰竭是多种心血管疾病的终末阶段，压力超负荷是导致心脏重构和心功能恶化的重要驱动因素之一。为了在分子层面理解压力超负荷如何引起左心室心肌的基因表达改变，该数据集以 transverse aortic constriction（TAC）诱导心力衰竭的大鼠模型为基础，并设置假手术对照，通过左心室心肌转录组分析来捕捉与心脏重构相关的变化。该数据集所属分类为循环系统疾病 / 心力衰竭，主题标签为 Other，其研究背景与心力衰竭新型分子靶点的发现密切相关，尤其是 G 蛋白偶联受体（GPCR）相关通路和 microRNA 调控的靶点网络。

【数据内容】

该数据集的核心内容是左心室心肌的转录组分析数据，研究对象包括接受 TAC 诱导心力衰竭的大鼠和假手术对照。数据所反映的是压力超负荷诱导心脏重构相关的基因表达变化。数据集被用于研究心力衰竭中的新型分子靶点，涵盖 GPCR 相关通路以及 microRNA 调控的靶点网络。关于具体的样本数量、测序平台、基因数量、表达矩阵格式等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。其采集基于大鼠模型：实验组接受 transverse aortic constriction（TAC）以诱导心力衰竭，对照组为假手术操作。采集的组织为左心室心肌，采集目的是进行转录组分析，以研究压力超负荷诱导心脏重构相关的基因表达变化。关于具体的采集时间点、手术细节、动物品系、样本处理流程等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心力衰竭分子机制研究，尤其是压力超负荷诱导心脏重构相关的基因表达变化分析。可用于探索心力衰竭中的新型分子靶点，包括 G 蛋白偶联受体（GPCR）相关通路和 microRNA 调控的靶点网络。也可作为循环系统疾病 / 心力衰竭方向转录组研究的参考数据，用于比较 TAC 诱导心力衰竭模型与假手术对照之间的左心室心肌转录组差异。关于具体的分析流程、统计方法或验证实验设计，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可用于左心室心肌转录组层面的差异表达分析与通路层面的探索性研究，围绕压力超负荷诱导心脏重构的基因表达变化展开。使用时可结合 GPCR 相关通路和 microRNA 调控靶点网络的研究视角进行解读。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、标准化方法及分析工具等具体使用说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 TAC 诱导心力衰竭大鼠模型与假手术对照的左心室心肌转录组分析，其设计围绕压力超负荷诱导心脏重构的基因表达变化。关于样本量、测序深度、数据完整性、批次效应、验证程度等质量相关指标，源站未提供。使用时应注意到该数据集来源于动物模型，其结论向人类心力衰竭的外推需谨慎；除此之外的具体限制信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJEB113868: Left ventricular myocardial transcriptomic profiling for target discovery in a rat model of pressure overload-induced heart failure。关于具体的引用文献、作者信息、许可条款及使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB113868

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB113868

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对 transverse aortic constriction（TAC）诱导心力衰竭的大鼠及假手术对照组大鼠进行了左心室心肌转录组分析，以研究与压力超负荷诱导的心脏重构相关的基因表达变化。该数据集已用于研究心力衰竭中新的分子靶点，包括 G 蛋白偶联受体（GPCR）相关通路和 microRNA 调控的靶点网络。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别