心肌梗死后5天人类心脏与健康供体对照的RNAseq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB105688

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：心肌梗死（MI）是全球主要死因之一，可导致人心内多达三分之一的心肌细胞（CMs）丢失。尽管CMs在早期发育过程中会进行有丝分裂，但大多数CMs在出生后不久便停止细胞周期循环。相比之下，啮齿动物MI模型显示，CMs在缺血刺激下会增强有丝分裂，但这一现象尚未在人类中得到证实。方法：我们利用一颗独特的MI后人类心脏（生前获取），结合免疫染色、bulk RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、单核RNA测序以及一种新型MI后人类活检方法，研究了MI后人类CM的有丝分裂情况。结果：我们发现，成年人类CMs在缺血刺激下表现出增强的有丝分裂和胞质分裂。结论：未来开发增强这种内在有丝分裂潜能的治疗手段，可能带来通过心脏再生逆转心力衰竭的新疗法。该数据集是与一颗独特梗死心脏相关的bulk RNAseq数据集——左心室（6004 LV）、右心室（6004 RV）、右心房（6004 RA）以及健康供体左心室（donor LV）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。