大规模蛋白质组学识别连接健康社会决定因素与心力衰竭风险的新生物标志物

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Abd16b09e5c63ba9d47de79314136d3962c2f127e624591ad928f92800a694e09

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

不良健康社会决定因素（SDOH）与更高的心力衰竭（HF）风险相关。在社区动脉粥样硬化风险（ARIC）队列研究的9，879名社区参与者中，我们使用基于适配体的平台（Somalogic）评估了4，955种血浆蛋白。我们在黑人和白人参与者中推导出一个由收入、教育和区域剥夺指数（ADI）构成的SDOH因子。在Bonferroni显著性水平上与该因子相关的蛋白质，通过多变量Cox比例风险模型测试其与 incident HF 的关联。在黑人参与者中，有36种蛋白质与SDOH因子和 incident HF 均相关，白人参与者中有126种，种族分层间共有12种。其中8种在因果中介模型中显示出显著的中介效应。关键结果在UK Biobank的49，396名参与者中得到了重复验证。

孟德尔随机化和共定位分析提示C1QTNF1（一种脂联素旁系同源物……）可能存在潜在因果效应。，# 数据来源：大规模蛋白质组学用于识别将健康社会决定因素与心力衰竭风险相关联的新型生物标志物 数据集DOI：10.5061/dryad.sn02v6xm9 ## 数据与文件结构说明 在动脉粥样硬化风险社区研究（ARIC）的黑人和白人参与者种族分层中，基于收入、教育水平和社区区域剥夺指数（ADI）采用探索性因子分析推导出一个SDOH因子。在校正年龄和性别后，与SDOH因子达到Bonferroni显著性的蛋白质，随后使用Cox回归校正HF危险因素，在错误发现率<0.05的水平上检验其与 incident HF 的关联。在两个种族分层中均与HF相关的蛋白质，通过因果中介分析评估其潜在中介作用，并通过孟德尔随机化（MR）和共定位评估其对HF的因果效应。该分析使用公开可用的……进行了重复验证。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。