缺血性左心室功能障碍患者冬眠心肌与对照组织的心肌基因表达

该数据集来自 NCBI,包含缺血性左心室功能障碍患者冬眠心肌与对照组织的心肌基因表达谱,共 1 个文件(GSE4704_series_matrix.txt.gz),基于 GPL127 芯片平台、物种为人类(9606)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL1279606
GSE4704: Myocardial gene expression of hibernating and control tissue from patients with ischemic left ventricular dysfunction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

缺血性左心室功能障碍患者冬眠心肌与对照组织的心肌基因表达

Myocardial gene expression of hibernating and control tissue from patients with ischemic left ventricular dysfunction

该数据集来自 NCBI,包含缺血性左心室功能障碍患者冬眠心肌与对照组织的心肌基因表达谱,共 1 个文件(GSE4704_series_matrix.txt.gz),基于 GPL127 芯片平台、物种为人类(9606)。源站描述指出,研究目的是通过基因表达分析识别人类冬眠心肌特有的新分子机制。数据可用于比较冬眠心肌与对照组织的表达差异,探索与可逆性收缩功能障碍相关的分子特征,并支持心肌缺血与心力衰竭相关机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 24 200。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:虽然心脏瘢痕组织不可逆受损,但冬眠心肌的特征是可逆性收缩功能障碍。关于人类冬眠心肌的分子生物学数据有限。本研究的目的是通过基因表达分析识别人类冬眠心肌特有的新分子机制。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL127、9606。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE4704

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 16 201,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:虽然心脏瘢痕组织是不可逆性损伤,但冬眠心肌的特征在于可逆性收缩功能障碍。关于人类冬眠心肌的分子生物学资料有限。本研究旨在通过基因表达分析,识别人类冬眠心肌特有的新分子机制。结果:在检测的4171个转录本中,我们鉴定出86个差异表达的转录本。冬眠心肌中有21个基因表达增加,65个基因表达减少。功能聚类分析显示,与转录、蛋白质修饰和磷酸化、细胞凋亡调控及细胞间通讯相关的基因表达发生了重大变化。除了已报道的心力衰竭中β-肾上腺素能受体激酶-1的上调外,我们还观察到新的基因表达模式,如fas激活的丝氨酸/苏氨酸激酶(FAST)的上调或桥粒斑蛋白表达的降低。

在冬眠心肌的心肌细胞中,桥粒斑蛋白的下调在蛋白质水平上也可见,这与该蛋白在扩张型心肌病发展中的作用相一致。结论:对冬眠心肌的基因表达分析为缺血性心力衰竭的分子机制提供了新的见解。桥粒功能障碍可能促进收缩力受损和扩张性组织重塑。关键词:疾病状态分析

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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