GSE282365：全基因组转录组揭示新生期高氧对心房与心室的不同反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE282365

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

暴露于补充氧气(高氧)的早产儿在以后的生活中有发生心力衰竭的风险。啮齿动物研究表明，出生后早期暴露于高氧会导致以后发生心力衰竭，这与早产儿人类的心力衰竭相似。新生儿高氧暴露对左心房和左心室的影响不同，抑制心房心肌细胞的增殖和存活，同时促进心室心肌细胞的分化。在这项研究中，全基因组转录组学揭示新生小鼠的左心房对高氧的反应比左心室更敏感，心房中有4，285个基因的表达受到影响，心室中有1，743个基因的表达受到影响。虽然高氧在两个腔室中都激活了p53靶基因，但它在心房中引起了更大的DNA损伤、DNA损伤反应性共济失调毛细血管扩张突变(ATM)激酶的磷酸化、线粒体应激和细胞凋亡。相反，高氧诱导了心室中DNA修复和生长停滞基因的表达。

心房细胞还表现出细胞外基质和超氧化物歧化酶3（SOD3）表达的更大缺失，这可能导致了高氧暴露小鼠左心房扩大及跨二尖瓣血流速度降低。因此，高氧暴露小鼠的舒张功能障碍和心力衰竭可能源于其对左心房的影响，提示可能需要针对心腔的特异性疗法来解决早产儿的舒张功能障碍和心力衰竭问题。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。