热射病患者免疫图谱数据集

该数据集来自 NCBI,标题为热射病患者免疫图谱,包含 1 个文件(GSE275259_series_matrix.txt.gz),采用高通量测序表达谱技术,物种为人类(9606),平台为 GPL24676

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基因组分类GPL246769606
GSE275259: Immune profiles of heatstroke patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

热射病患者免疫图谱数据集

GSE275259 是一个来自 NCBI 的基因表达数据集,英文标题为“Immune profiles of heatstroke patients”,中文可译为热射病患者免疫图谱。该数据集聚焦热射病患者的免疫系统特征,采用高通量测序表达谱技术,研究对象为人类(物种编号 9606),测序平台为 GPL24676。数据集共包含 1 个文件,即 GSE275259_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供。该数据集的作者为 Juan,Wu,发布时间为 Aug 20 202。数据集在本地分类中归入循环系统疾病 / 心力衰竭方向,主题标签涵盖 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 与 9606。整体而言,该数据集为研究热射病相关的免疫系统变化提供了表达谱层面的数据资源。

【数据集背景】

热射病是由高温导致的最具生命威胁的疾病之一,但缺乏快速诊断的生物标志物。免疫系统紊乱是“双通路模型”的常见特征,该模型以内毒素血症和高温为特征,但免疫系统的具体图谱尚不清楚。该数据集正是围绕热射病患者免疫图谱这一主题构建,旨在呈现热射病患者免疫系统在表达谱层面的特征,为理解热射病相关的免疫紊乱提供数据基础。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE275259_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件,承载高通量测序表达谱数据。数据集的主题标签表明其属于高通量测序表达谱类型,物种为人类(9606),平台为 GPL24676。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或具体基因层面的内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Immune profiles of heatstroke patients”。作者为 Juan,Wu,发布时间为 Aug 20 202。数据以 GSE275259 编号组织,通过系列矩阵文件对外提供。关于样本采集地点、采集时间、受试者纳入标准及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于热射病免疫特征相关的表达谱分析场景,可用于探索热射病患者免疫系统紊乱的表达层面表现,也可作为循环系统疾病 / 心力衰竭方向相关研究的参考数据。由于主题标签包含高通量测序表达谱与人类物种信息,其数据形式适合开展基因表达层面的比较与描述性分析。具体研究用途应结合使用者自身的研究设计与分析目标确定,源站未提供针对特定应用的说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE275259_series_matrix.txt.gz,按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段或编码不一致导致的分析偏差。关于数据预处理、标准化及分析流程的细节,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本量、重复设计、数据完整性评估或质量控制指标等信息。由于缺乏上述细节,使用者在使用前应自行核对数据字段与编码,并结合研究目的评估数据适用性。源站未提供关于数据质量的其他说明。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Juan,Wu,发布时间为 Aug 20 202。关于引用格式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275259

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:热射病是由高热引起的最危及生命的疾病,但缺乏快速诊断的生物标志物。免疫系统紊乱是“双通路模型”的共同特征,该模型以内毒素血症和高热为特征,但免疫系统的具体特征尚不清楚。目的:本研究旨在探索能够区分热射病与无菌性炎症和脓毒症患者的特异性免疫特征,并寻找鉴别热射病与脓毒症的诊断生物标志物。方法:招募四组患者:热射病患者(HS组)、脓毒症患者(Sepsis组)、接受体外循环的患者(CPB组)和健康对照(HC组)。采用倾向性评分分析,按年龄和性别将HS患者与HC组、CPB组和Sepsis组患者进行1:1匹配。主要结局为全因死亡率,次要结局为30天内神经功能障碍(包括卒中和谵妄)、急性心力衰竭、急性肾衰竭或急性肺损伤的发生率。

入院后24小时内从健康参与者、HS和脓毒症患者中采集血液,对于CPB患者则在CPB结束时采集血液。该血液用于进行光谱流式细胞术、测定炎症介质和热休克蛋白-70的血浆水平,以及处理单细胞RNA测序(sc-RNA seq)以评估T细胞、B细胞、单核细胞和NK细胞的图谱。HS和脓毒症患者在入院后随访30天,而CPB患者在术后随访30天,以记录主要和次要结局的发生率。结果:HS中TLR4+单核细胞的比例高于HC、CPB和Sepsis组,且能够区分热射病与脓毒症。在HS中,HLA基因(HLA-A、HLA-B、HLA-DRA和HLA-DRB1)的上调、抗原呈递的激活以及趋化性的抑制

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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