心脏表达谱分析（NH、TAC与TAC-R）
数据基于表达谱芯片（GPL23040，物种10116）对全心脏RNA样本进行转录组分析，涵盖NH、TAC和TAC-R三种条件
基本信息
资源简介
心脏表达谱分析（NH、TAC与TAC-R）
GSE270186 是一个面向心脏转录组研究的表达谱数据集，源站标题为“Expression Profiling of Heart (NH, TAC and TAC-R)”，在站内归入循环系统疾病 / 心力衰竭分类，来源为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集基于表达谱芯片平台 GPL23040，物种标识为 10116，对全心脏 RNA 样本进行转录组分析，涵盖 NH、TAC 和 TAC-R 三种条件。数据集由 Manabu、Shiraishi 提交，发布时间为 Jun 18 202，共包含 1 个文件，样例文件为 GSE270186_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集以芯片表达谱的形式提供了心脏组织在三种不同条件下的转录组层面信息，可供心力衰竭相关研究参考使用。
【数据集背景】
该数据集聚焦于心脏组织的表达谱分析，站内分类为循环系统疾病 / 心力衰竭。源站描述指出，其内容为来自全心脏的 RNA 样本的转录组分析。数据集标题中列出的三种条件——NH、TAC 与 TAC-R——构成了该表达谱研究的分组框架，主题标签中包含“Expression profiling by array”，表明数据通过芯片技术产生。关于各条件的具体定义、实验设计细节与生物学含义，源站未提供。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE270186_series_matrix.txt.gz，即系列矩阵文件，以 GZIP 压缩格式分发。该文件承载全心脏 RNA 样本在 GPL23040 芯片平台上的表达谱测量结果，覆盖 NH、TAC 和 TAC-R 三种条件。主题标签中列出的 GPL23040 为芯片平台标识，10116 为物种标识。除上述文件与标签信息外，源站未提供关于样本数量、探针数量、表达值类型或矩阵字段构成的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Expression Profiling of Heart (NH, TAC and TAC-R)”，源站描述说明其内容是对全心脏 RNA 样本的转录组分析。数据集作者为 Manabu、Shiraishi，发布时间为 Jun 18 202。数据通过表达谱芯片方式产生，平台标识为 GPL23040，物种标识为 10116。关于样本采集流程、组织处理方式、RNA 提取与芯片杂交实验的具体步骤，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于心脏转录组层面的表达谱研究，尤其是与心力衰竭相关的分析场景。由于数据涵盖 NH、TAC 和 TAC-R 三种条件，可用于比较不同条件下全心脏样本的基因表达模式。芯片表达谱数据常见的用途包括差异表达分析、表达模式聚类与通路层面的探索性分析。关于该数据集是否已被用于特定研究结论或是否适合特定分析流程，源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE270186_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包，需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含一个系列矩阵文件，读取时应关注矩阵中的样本列与表达值行之间的对应关系。关于矩阵文件的具体字段含义与注释信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，即以系列矩阵形式提供的表达谱数据，未提供原始芯片图像或未处理数据文件。数据基于芯片平台 GPL23040，物种标识为 10116，其表达谱结果受平台特性与样本处理方式影响。关于数据集的质控指标、缺失值情况、批次信息与重复样本设置，源站未提供。使用时应注意芯片表达谱数据的常规局限，并在分析前核对数据完整性与字段编码。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Manabu、Shiraishi，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 Jun 18 202。使用或引用时应注明数据集名称 GSE270186 及其来源。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270186
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
全心脏RNA样本的转录组分析
横向主动脉缩窄（TAC）是研究心脏肥厚动物模型中心力衰竭病理机制的成熟方法。多项研究表明，在该心脏肥厚动物模型中治疗心力衰竭提示肥厚和纤维化可能是可逆的。然而，由于通过解除物理狭窄以改善血流动力学的TAC释放方案尚未明确，心脏肥厚和纤维化可逆性的组织学特征及分子生物学调控机制仍不清楚。因此，本研究旨在建立TAC释放模型，并探讨心肌肥厚、纤维化和血管新生的可逆性及可塑性机制。TAC术后四周，通过剪断主动脉狭窄缝线实施TAC释放。TAC组表现出严重的心肌肥厚、纤维化和血管新生增加，并伴有舒张功能障碍。相反，TAC释放组显示肥厚和纤维化减轻，舒张功能改善。
基因表达分析突显了钙调磷酸酶调节因子1在TAC解除后心脏功能及组织学变化中的关键作用。Rcan1敲低加剧了TAC解除组的心肌肥厚和纤维化。本研究揭示了TAC解除诱导的心脏功能、结构和组织学变化，并阐明了一些调控机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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