cMyBP-CΔC10mut HCM小鼠与cMyBP-C(t/t) DCM小鼠基因表达模式数据集

该数据集来自NCBI GEO,包含cMyBP-CΔC10mut肥厚型心肌病(HCM)小鼠与cMyBP-C(t/t)扩张型心肌病(DCM)小鼠的基因表达谱数据,采用高通量测序(RNA Sequencing)技术

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基因组分类GPL2110310090
GSE262253: Gene expression patterns in cMyBP-CΔC10mut HCM mice and cMyBP-C(t/t) DCM mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

cMyBP-CΔC10mut HCM小鼠与cMyBP-C(t/t) DCM小鼠基因表达模式数据集

Gene expression patterns in cMyBP-CΔC10mut HCM mice and cMyBP-C(t/t) DCM mice

该数据集来自NCBI GEO,包含cMyBP-CΔC10mut肥厚型心肌病(HCM)小鼠与cMyBP-C(t/t)扩张型心肌病(DCM)小鼠的基因表达谱数据,采用高通量测序(RNA Sequencing)技术。数据可用于分析HCM和DCM模型中肌肉收缩及蛋白酶体相关基因的失调模式,支持心肌病分子机制研究与差异表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):心脏肌球蛋白结合蛋白-C(cMyBP-C)基因(MYBPC3)中一个25碱基对的缺失,被认为会跳过外显子33,修饰C10结构域(cMyBP-CΔC10mut),并与肥厚型心肌病(HCM)和心力衰竭相关,影响约1亿南亚人。然而,cMyBP-CΔC10mut在体内致病性的分子机制尚不清楚。为了确定cMyBP-CΔC10mut的表达是否足以在体内引起HCM和收缩功能障碍,我们生成了转基因(TG)小鼠,其心脏特异性蛋白表达cMyBP-CΔC10mut的水平约为内源性cMyBP-C的一半。在12周龄时,表达cMyBP-CΔC10mut的TG小鼠中观察到显著肥大。此外,RNA测序揭示与肌肉收缩和蛋白酶体生物学过程相关的基因失调。同样,为了确定肌

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21103、10090。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262253

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 25 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

心脏肌球蛋白结合蛋白-C(cMyBP-C)基因(MYBPC3)中一个25碱基对的缺失,被认为会导致外显子33跳跃,修饰C10结构域(cMyBP-CΔC10mut),并与肥厚型心肌病(HCM)和心力衰竭相关,影响约1亿南亚人群。然而,cMyBP-CΔC10mut在体内致病性的分子机制尚不清楚。为确定cMyBP-CΔC10mut的表达是否足以在体内引起HCM和收缩功能障碍,我们构建了转基因(TG)小鼠,其心脏特异性表达cMyBP-CΔC10mut蛋白,表达水平约为内源性cMyBP-C的一半。在12周龄时,表达cMyBP-CΔC10mut的TG小鼠出现显著心肌肥厚。RNA测序还显示,与肌肉收缩和蛋白酶体生物学过程相关的基因发生失调。同样,为确定心肌炎症是否与MYBPC3突变所致扩张型心肌病(DCM)中的心脏功能障碍相关,我们使用了3月龄、特征明确的cMyBP-C(t/t) DCM小鼠模型。RNA-seq分析显示,DCM心脏中炎症通路上调。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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