GSE247626:调控损伤反应的空间限制以促进心脏修复
研究整合单细胞与空间转录组分析,报道 Lyz2 可指示整体损伤状态并影响损伤后心脏功能,将溶酶体-基质体 Lyz2 调控子与心脏损伤的解剖和功能相关性联系起来,并提示该空间模型在小鼠和人类多种损伤类型中具有一致性

基本信息
资源简介
GSE247626:调控损伤反应的空间限制以促进心脏修复
Modulate spatial restriction of injury responses for cardiac repair
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Modulate spatial restriction of injury responses for cardiac repair,聚焦循环系统疾病中的心力衰竭。数据基于高通量测序表达谱,包含 1 个文件 GSE247626_series_matrix.txt.gz,涉及小鼠(10090)与平台 GPL21273。研究整合单细胞与空间转录组分析,报道 Lyz2 可指示整体损伤状态并影响损伤后心脏功能,将溶酶体-基质体 Lyz2 调控子与心脏损伤的解剖和功能相关性联系起来,并提示该空间模型在小鼠和人类多种损伤类型中具有一致性。可用于探索心脏损伤反应的空间调控机制及潜在干预靶点(来源 NCBI。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 13 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):器官层面对损伤刺激的内在分子策略仍不清楚。识别并调控这种潜在的全身适应损伤的分子策略在理论上引人入胜,在治疗上也颇具前景。在此,我们利用整合的单细胞和空间转录组分析,报道了溶菌酶2(Lyz2)——一个长期确立的髓系标志物——出乎意料地指示了整体损伤状态(跨细胞类型和解剖分区),并影响损伤后的心脏功能。我们将溶酶体-基质体(特别是心内膜溶酶体降解性Hspgs)的Lyz2调控子与心脏损伤的解剖和功能相关性联系起来,并确定这种空间模型在多种损伤类型中具有一致性,无论小鼠还是人类。通过基因缺失或化学抑制在成年小鼠中调控由Lyz2介导的空间模型,在心肌
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21273、10090。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247626
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 28 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
器官层面对损伤刺激的内在分子策略仍难以捉摸。识别并调控这种潜在的分子策略以实现对损伤的全身性适应,在理论上极具吸引力,在治疗上也颇具前景。在此,我们利用整合的单细胞和空间转录组分析,报道了溶菌酶2(Lyz2)——一个长期以来公认的髓系标志物——出乎意料地指示了整体损伤状态(跨细胞类型和解剖分区),并影响损伤后的心脏功能。我们将溶酶体-基质体(特别是心内膜溶酶体降解性Hspgs)的Lyz2调控子与心脏损伤的解剖和功能相关性联系起来,并确定这种空间模型在多种损伤类型中具有一致性,无论在小鼠还是人类中均是如此。在成年心肌梗死小鼠中,通过基因缺失或化学抑制对Lyz2介导的空间模型进行调控,显著地取得了即刻的保护效果,这在当前心力衰竭干预措施中是一种罕见的治疗获益。
这些结果为心脏采用的史无前例的分子策略提供了首个分子层面的证据,展现出在器官修复方面前所未有的治疗前景。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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