GSE227734：单细胞测序揭示过表达Cox7B在肥厚型心肌病中的心脏保护作用

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227734

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数据说明

肥厚型心肌病（HCM）是导致心力衰竭的重要原因。保护心脏功能，尤其是心肌细胞（CMs）的功能，对于改善HCM患者的预后至关重要。因此，了解HCM中心肌细胞的单细胞转录组特征对于研究潜在治疗靶点不可或缺。我们采用单细胞标记逆转录（STRT-seq）方法，获得了338个心肌细胞转录组。人类心脏样本采集自接受扩大室间隔心肌切除术的HCM患者和健康供体。我们的结果揭示，在非衰竭HCM心脏中，心肌细胞可分为三个亚群：高能量合成簇、高细胞代谢簇和中间簇。在高能量合成簇中较大尺寸的心肌细胞里，线粒体和电子传递链（ETC）的表达上调。值得注意的是，我们发现ETC中复合物IV的一个亚基——细胞色素c氧化酶亚基7B（Cox7B）的表达与心肌细胞大小呈正相关。

此外，在评估HCM患者的Cox7B表达后，我们推测Cox7B在HCM早期呈代偿性上调，而在终末期下调。为验证Cox7B可能在HCM早期发挥心脏保护作用的假设，我们使用腺相关病毒9（AAV9）介导压力超负荷诱导小鼠中Cox7B的表达。小鼠体内数据支持，敲低Cox7B会加速心力衰竭进展，而Cox7B过表达可部分恢复肥厚心脏的功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。