连续流左心室辅助装置患者主动脉瓣蛋白水平与壁面剪切应力及振荡剪切指数的相关性
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦连续流左心室辅助装置（LVAD）患者主动脉瓣结构蛋白水平与超声心动图血流动力学指标的关系
基本信息
资源简介
连续流左心室辅助装置患者主动脉瓣蛋白水平与壁面剪切应力及振荡剪切指数的相关性
该数据集聚焦于连续流左心室辅助装置（LVAD）支持患者的主动脉瓣结构蛋白水平与超声心动图血流动力学指标之间的关联。连续流LVAD在临床应用中常导致主动脉瓣反流，进而降低泵效率并加重心力衰竭。为探究其潜在机制，研究者提出假说：非生理性的壁面剪切应力与振荡剪切指数可能改变LVAD患者主动脉瓣中结构蛋白的丰度。数据集整合了接受心脏移植患者的主动脉瓣多普勒图像、主动脉瓣组织质谱蛋白质组学分析结果，以及基于超声心动图计算得到的壁面剪切应力和振荡剪切指数，并评估了单个蛋白归一化水平与在体超声心动图测量值之间的关系。该数据集属于循环系统疾病/心力衰竭领域，主题标签为蛋白质组学，来源于omicsdi.org。
【数据集背景】
连续流左心室辅助装置（LVAD）是终末期心力衰竭的重要治疗手段，但其长期支持常伴随主动脉瓣反流，导致泵效率下降和心力衰竭恶化。主动脉瓣在非生理性血流动力学环境下可能发生结构重塑，而瓣膜结构蛋白的丰度变化可能是这一过程的重要分子基础。该数据集正是围绕这一临床问题构建，旨在通过蛋白质组学与影像学指标的关联分析，探索LVAD支持下主动脉瓣结构蛋白水平与壁面剪切应力、振荡剪切指数之间的关系。研究纳入接受心脏移植的患者，其中8例曾接受LVAD支持，10例未接受LVAD支持，通过对比分析揭示LVAD对主动脉瓣蛋白表达及血流动力学环境的潜在影响。
【数据内容】
数据集包含多模态信息：一是主动脉瓣组织的质谱蛋白质组学数据，用于分析结构蛋白的丰度；二是超声心动图影像数据，包括主动脉瓣的多普勒图像，用于计算壁面剪切应力和振荡剪切指数；三是归一化后的单个蛋白水平与在体超声心动图测量值之间的关联分析结果。源站描述提及，在57个目标蛋白中，观察到强烈的负相关关系。数据集的主题标签为蛋白质组学，分类归属于循环系统疾病/心力衰竭。关于数据的具体样本量、蛋白列表、统计值等详细信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。研究对象为接受心脏移植的患者，其中8例曾接受LVAD支持，10例未接受LVAD支持。主动脉瓣组织在移植时采集，并通过质谱法进行蛋白质水平分析。超声心动图图像用于计算壁面剪切应力和振荡剪切指数。研究将归一化后的单个蛋白水平与在体超声心动图测量值进行关联评估。源站未提供具体的采集时间、地点、设备型号及伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于以下研究方向：LVAD支持下主动脉瓣病理生理机制的探索；血流动力学指标（壁面剪切应力、振荡剪切指数）与瓣膜结构蛋白表达关联的分析；心力衰竭患者主动脉瓣重塑的蛋白质组学研究；以及超声心动图血流动力学参数与分子标志物整合分析的方法学参考。此外，也可用于比较LVAD支持与非LVAD支持患者主动脉瓣蛋白水平的差异，为理解LVAD相关主动脉瓣反流提供线索。
【使用方法】
使用者可基于该数据集进行蛋白水平与超声心动图指标的关联分析，重点关注壁面剪切应力和振荡剪切指数与结构蛋白归一化水平之间的关系。分析时需注意区分LVAD支持组与非LVAD支持组，并考虑样本量较小带来的统计效力限制。源站未提供具体的数据格式、访问方式及分析工具，建议参考omicsdi.org上的原始记录获取进一步信息。
【质量与限制】
该数据集的优势在于整合了蛋白质组学与影像学血流动力学指标，提供了多模态关联分析的可能。然而，源站描述中未提供完整的统计结果、蛋白列表及样本特征，且样本量较小（LVAD组8例，非LVAD组10例），可能限制结论的普遍性。此外，源站未提供数据质量控制、缺失值处理及标准化方法等细节。因此，使用时应谨慎解读关联性结果，并注意其探索性研究性质。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000086941
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
连续流左心室辅助装置常导致主动脉瓣反流，进而降低泵效率并加重心力衰竭。我们假设非生理性壁面剪切应力和振荡剪切指数会改变左心室辅助装置（LVAD）患者主动脉瓣中结构蛋白的丰度。获取了接受心脏移植患者主动脉瓣的多普勒图像。其中8名患者曾接受LVAD支持，而10名未接受。收集主动脉瓣组织，并使用质谱法分析蛋白质水平。分析超声心动图图像并计算壁面剪切应力和振荡剪切指数。评估了各蛋白质归一化水平与体内超声心动图测量值之间的关系。在57种关注的蛋白质中，有15种蛋白质的水平与壁面剪切应力呈强负相关（R < -0.500，p ? 0.05），另有16种蛋白质与壁面剪切应力呈中度负相关（R ?0.500至?0.300，p ? 0.05）。基因本体分析显示，这些蛋白质聚类涉及细胞结构。
与WSS呈负相关的蛋白质包括具有细胞骨架、肌动蛋白/肌球蛋白、细胞间连接和细胞外功能的蛋白质。在主动脉瓣组织中，鉴定出31种参与细胞结构和细胞外连接的蛋白质，其水平与壁面剪切应力呈负相关。这些发现提示作用于主动脉瓣（AV）的力与瓣叶蛋白质丰度之间存在关联，并可能构成LVAD患者主动脉瓣叶退化风险增加的力学基础。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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