Gefitinib在体内差异调控小鼠心脏转录本表达中β-肾上腺素能受体依赖性的改变
该数据集来自search.dataone.org,属于循环系统疾病/心力衰竭分类,包含C57BL/6小鼠在注射βAR激动剂isoproterenol并联合或不联合EGFR拮抗剂gefitinib 1小时后心脏全转录组分析数据

基本信息
资源简介
Gefitinib在体内差异调控小鼠心脏转录本表达中β-肾上腺素能受体依赖性的改变
β-adrenergic receptor-dependent alterations in murine cardiac transcript expression are differentially regulated by gefitinib in vivo
该数据集来自search.dataone.org,属于循环系统疾病/心力衰竭分类,包含C57BL/6小鼠在注射βAR激动剂isoproterenol并联合或不联合EGFR拮抗剂gefitinib 1小时后心脏全转录组分析数据。数据覆盖心脏转录本表达变化,可用于研究βAR依赖性EGFR反式激活在体内对心脏转录表达的调控作用(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):β-肾上腺素能受体(βAR)介导的表皮生长因子受体(EGFR)反式激活已被证明可在心力衰竭小鼠模型中促进心脏保护,我们最近表明该机制部分通过调节分离的原代大鼠新生心肌细胞中凋亡转录本表达来增强细胞存活。因此,我们假设该过程可在体内调节心脏转录本表达。为全面评估急性βAR依赖性EGFR反式激活引起的心脏转录本改变,我们对腹腔注射βAR激动剂isoproterenol并联合或不联合EGFR拮抗剂gefitinib 1小时的C57BL/6小鼠心脏进行了全转录组分析。来自每个处理组的总心脏RNA underwent转录组分析,揭示大量转录本受调控。
【主题与分类】
主题标签:Mus musculus、mouse、epidermal growth factor receptor、transcripts、heart、beta adrenergic receptor。本站分类:循环系统疾病/心力衰竭。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A8266fa3098933805ebd564fdea61d5ed70f9c1ba1bc2972a399e9060ec7caac7
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- OpenDataLab:
数据说明
β-肾上腺素能受体(βAR)介导的表皮生长因子受体(EGFR)反式激活已被证明可在心力衰竭小鼠模型中促进心脏保护作用,而我们最近表明,该机制部分通过调控离体原代大鼠新生心肌细胞中凋亡转录本表达来增强细胞存活。因此,我们假设该过程可在体内调控心脏转录本表达。为全面评估急性βAR依赖性EGFR反式激活引起的心脏转录本改变,我们对腹腔注射βAR激动剂异丙肾上腺素(伴或不伴EGFR拮抗剂吉非替尼)1小时的C57BL/6小鼠心脏进行了全转录组分析。对各处理组的总心脏RNA进行转录组分析,揭示了各处理调控的大量转录本。单用吉非替尼显著改变了405个转录本的表达,而单用异丙肾上腺素或异丙肾上腺素联合吉非替尼分别显著改变了493个和698个不同的转录本。
进一步的统计分析得以实施,确认了473个转录本受异丙肾上腺素的调节,而这些调节被吉非替尼显著改变(吉非替尼拮抗/促进了异丙肾上腺素诱导的上调/下调),其中包括一些已知参与调控包括细胞死亡和存活在内的众多过程的转录本。因此,体内βAR依赖的心脏转录表达调控可被EGFR拮抗剂吉非替尼所调节。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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