基于转录组测序探索梓醇对糖尿病勃起功能障碍大鼠模型作用机制的原始RNA-seq数据及分析代码

该数据集包含用于研究梓醇治疗糖尿病勃起功能障碍作用机制的原始RNA测序数据(转录组学数据模态)及配套分析代码,通过构建大鼠模型、进行差异表达分析和网络构建,鉴定出Kdr、Vcam1等关键基因,旨在揭示疾病分子机制并为靶向治疗提供数据支持,主要应用于生物医学机制探索和药物靶点发现研究。

kaifa, Tangkaifa, Tang
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2025-12-11 更新
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分类转录组学糖尿病勃起功能障碍
Raw RNA-seq data and analysis code for the study: Exploring the mechanism of action of catalpol on the rat model of diabetic erectile dysfunction via transcriptome sequencing

基本信息

大小
0.005779852 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-12-11
版本
v1

资源简介

基于转录组测序探索梓醇对糖尿病勃起功能障碍大鼠模型作用机制的原始RNA-seq数据及分析代码

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Raw RNA-seq data and analysis code for the study:Exploring the mechanism of action of catalpol on the rat model of diabetic erectile dysfunction via transcriptome sequencing》。项目资助方:Guizhou Provincial Science and Technology Plan Project (Qiankehe Chengguo-LC[2024]097); Academic New Seedling Program of Guizhou University of Traditional Chinese Medicine ( Guikehe Xueshu Xinmiao[2023]-09).The Science and Technology Fund Project of Guizhou Provincial Health Commission (gzwkj2025-326).The Science and Technology Fund Project of Guizhou Provincial Health Commission (gzwkj2025-332).。源站首次发布:2025-12-11。

【数据内容】

源站原始描述:勃起功能障碍(ED)在糖尿病(DM)患者中很常见。Catalpol可以改善糖尿病状况,但其对DM诱发ED(DMED)的调控机制尚不明确。本研究分析转录组数据以识别与Catalpol相关的基因和机制,旨在支持新的治疗靶点。在对照组与DMED组之间,以及DMED组与catalpol组之间进行了差异表达分析。通过文氏图分析获得了常见的差异表达基因3(DEGs3)。关键基因(KGs)通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析被鉴定出。通过染色体定位、表达剖析、WebGestalt富集、miRNA-KGs网络构建和分子结合模拟,探索了其对DMED的调控机制。最终建立了大鼠模型(分为对照组、DMED组和catalpol组),并通过免疫组化(IHC)和逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)分析验证了关键基因的表达。总体而言,对照组与DMED组分别检测到786个DEGs1和3084个DEGs2,DMED组与Catalpol组不同。共识别出378个DEGs3。其中,发现Kdr、Vcam1、Sox18和Emcn共同被鉴定为KGs。染色体定位显示Vcam1和Emcn位于2号染色体,Sox18位于3号染色…

主表 01.counts.csv 含 16 列、样本前 2000 行结构完整。

主表 01.FPKM.csv 含 16 列、样本前 2000 行结构完整。

主表 01.group.counts.csv 含 2 列、样本前 16 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 5.78 MB。01.counts.csv:text/csv,1.30 MB。01.FPKM.csv:text/csv,4.48 MB。01.group.counts.csv:text/csv,442 B。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.30855302.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medical biochemistry - nucleic acids。主题标签:Diabetes Mellitus, Erectile Dysfunction, RNA Sequencing, Diabetic Rat Model, Catalpol Monomer。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。源站学科分类标注为 Medical biochemistry - nucleic acids。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Raw_RNA-seq_data_and_analysis_code_for_the_study_Exploring_the_mechanism_of_action_of_catalpol_on_the_rat_model_of_diabetic_erectile_dysfunction_via_transcriptome_sequencing/30855302

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:kaifa, Tang (2025). Raw RNA-seq data and analysis code for the study:Exploring the mechanism of action of catalpol on the rat model of diabetic erectile dysfunction via transcriptome sequencing. figshare. Dataset

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数据说明

该数据集是一项关于梓醇(catalpol)治疗糖尿病勃起功能障碍(DMED)作用机制研究的转录组学资源。数据集包含通过大鼠模型实验获取的原始RNA测序数据以及配套的生物信息学分析代码。研究构建了对照组、DMED模型组和梓醇治疗组三组大鼠样本,通过差异表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、功能富集分析、miRNA-靶基因调控网络分析以及分子对接模拟等多种方法,系统探索了梓醇改善DMED的分子机制。研究最终鉴定出Kdr、Vcam1、Sox18和Emcn等关键基因,并通过免疫组化(IHC)和RT-qPCR实验进行了验证。该数据集为理解糖尿病勃起功能障碍的发病机制及寻找潜在治疗靶点提供了重要的多组学数据支持,主要应用于生物医学、药物发现和男性生殖健康研究领域。

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