人核纤层蛋白Coil 2b结构
该数据集包含人类核纤层蛋白A/C中Coil 2b结构域的三维蛋白质结构数据,通过X射线衍射方法获得,分辨率为3埃,并涵盖与扩张型心肌病相关的R335W和E347K突变体结构信息,主要用于研究核纤层蛋白结构异常在扩张型心肌病(cardiolaminopathies)发生发展中的分子机制,为疾病病理探索和潜在治疗靶点提供结构生物学依据。

基本信息
资源简介
人核纤层蛋白Coil 2b结构
【一句话概览】
该数据集条目涉及人类核纤层蛋白(human lamin)的卷曲2b(Coil 2b)结构,源站标题为“Structure of Coil 2b of human lamin”,原始描述与标签均标注为“STRUCTURAL PROTEIN”,即结构蛋白(来源 RCSB PDB)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Structure of Coil 2b of human lamin》。
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.12.136。
【主题与分类】
主题标签:STRUCTURAL PROTEIN。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/3V5B
规范引用:Structures of the lamin A/C R335W and E347K mutants: Implications for dilated cardiolaminopathies. (2012) Biochem.Biophys.Res.Commun
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数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/3v5b
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集为人类核纤层蛋白A/C(Prelamin-A/C)中Coil 2b结构域的三维结构数据,通过X射线衍射方法解析,分辨率为3埃。数据包含与扩张型心肌病相关的R335W和E347K突变体结构信息,来源于2012年发表的生物化学与生物物理研究通讯论文。该数据集主要用于研究核纤层蛋白结构异常与扩张型心肌病(cardiolaminopathies)分子机制之间的关联,为疾病病理研究和药物靶点发现提供结构基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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