H19 lncRNA遗传变异与扩张型心肌病关联数据集
该数据集包含1084名扩张型心肌病患者和751名健康对照的基因型数据,主要研究H19长链非编码RNA中一个特定单核苷酸多态性(SNP)对RNA二级结构的影响及其与疾病的关联,通过计算预测和实验验证相结合的方法,揭示了该遗传变异如何改变RNA结构并可能影响心脏发育调控,为心血管疾病的分子机制研究提供了重要的多模态数据(基因型、RNA结构、临床表型)。

基本信息
资源简介
H19 lncRNA遗传变异与扩张型心肌病关联数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《A genetic variant alters the secondary structure of the lncRNA H19 and is associated with dilated cardiomyopathy》。配套论文《A genetic variant alters the secondary structure of the lncRNA H19 and is associated with dilated cardiomyopathy》发表于 RNA Biology(2021),DOI:10.1080/15476286.2021.1952756。项目资助方:This work was supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft [281125614/GRK 2220]; Else Kröner-Fresenius-Stiftung [No.: 2018_EKES.38]; Innovative Medical Research of the University of Münster Medical School [RÜ121510].。源站首次发布:2021-07-27。
【数据内容】
源站原始描述:lncRNAs are at the core of many regulatory processes and have also been recognized to be involved in various complex diseases. They affect gene regulation through direct interactions with RNA, DNA or proteins. Accordingly, lncRNA structure is likely to be essential for their regulatory function. Point mutations, which manifest as SNPs (single nucleotide polymorphisms) in genome screens, can substantially alter their function and, subsequently, the expression of their downstream regulated genes.…
文件 figureS1.ps 为文本内容,开头为:%!PS-Adobe-3.0 %%Creator: cairo 1.14.6 (http://cairographics.org) %%CreationDate: Thu Aug 6 17:18:37 2020 %%Pages: 1 %%DocumentData: Clean7Bit %%LanguageLevel…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个,合计 5.82 MB。Supplement Table_rev2.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,313.22 KB。downloadFromZipFile.pdf:application/pdf,733.50 KB。figureS1.ps:application/postscript,4.78 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.15060842.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Biophysics、Medicine、Genetics、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签:RNA structure、lncRNA、cardiovascular disease、RiboSNitch、Boltzmann ensemble、minimum free energy、SHAPE-Seq、H19、rs217727、SNP。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Medicine、Genetics、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。
【获取与许可】
源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/A_genetic_variant_alters_the_secondary_structure_of_the_lncRNA_H19_and_is_associated_with_dilated_cardiomyopathy/15060842
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:A genetic variant alters the secondary structure of the lncRNA H19 and is associated with dilated cardiomyopathy. Taylor & Francis. Martens, Leonie; Rühle, Frank; Witten, Anika; Meder, Benjamin; Katus, Hugo A.; Arbustini, Eloisa; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-03-21,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于长链非编码RNA H19的遗传变异与扩张型心肌病的关联研究。数据集包含1084名扩张型心肌病患者和751名健康对照的基因型数据,重点关注H19 lncRNA区域的一个单核苷酸多态性(SNP)。通过最小自由能折叠和SHAPE-Seq实验验证,该数据集揭示了该SNP如何显著改变H19 lncRNA的二级结构和热力学概率分布,从而影响其调控功能。该数据集为理解lncRNA结构变异在心血管疾病中的分子机制提供了重要资源,适用于生物信息学、结构生物学和心血管疾病遗传学研究。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




