系统遗传学方法揭示蛋白酶体因子在心脏发育和先天性心脏缺陷中的作用数据集
该数据集包含通过系统遗传学方法研究先天性心脏缺陷的原始实验数据,主要涉及斑马鱼模型中的基因功能验证,数据模态包括基因表达、蛋白质相互作用网络以及心脏形态与功能的表型观察,主要用于探索蛋白酶体相关基因在心脏发育过程中的作用机制,为先天性心脏缺陷的病因研究提供遗传学依据。
基本信息
资源简介
该数据集是一项系统遗传学研究的原始数据,旨在探索先天性心脏缺陷(CHDs)的遗传机制。数据集包含通过CRISPR技术在斑马鱼胚胎中靶向敲除候选基因(特别是蛋白酶体相关基因如POMP、PSMA6、PSMA7、PSMD3、PSMD6等)所产生的心脏发育相关实验数据。数据来源包括蛋白质相互作用网络分析、斑马鱼心脏表型观察(如心脏形态异常、心肌细胞起泡、流出道减少等)以及心脏功能评估。该数据集主要用于研究蛋白酶体基因家族在心脏发育过程中的作用,为先天性心脏缺陷的遗传病因学提供新的见解。
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一项系统遗传学研究的原始数据,旨在探索先天性心脏缺陷(CHDs)的遗传机制。数据集包含通过CRISPR技术在斑马鱼胚胎中靶向敲除候选基因(特别是蛋白酶体相关基因如POMP、PSMA6、PSMA7、PSMD3、PSMD6等)所产生的心脏发育相关实验数据。数据来源包括蛋白质相互作用网络分析、斑马鱼心脏表型观察(如心脏形态异常、心肌细胞起泡、流出道减少等)以及心脏功能评估。该数据集主要用于研究蛋白酶体基因家族在心脏发育过程中的作用,为先天性心脏缺陷的遗传病因学提供新的见解。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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