Cathgen登记库冠心病患者全血细胞基因表达谱

该数据集来自 omicsdi.org,收录 Cathgen Registry 中冠心病患者接受心导管检查前的全血细胞基因表达谱数据

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Whole Blood Cell Gene Expression Profiling in Patients with Coronary Artery Disease from the Cathgen Registry

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

Cathgen登记库冠心病患者全血细胞基因表达谱

该数据集为全血细胞基因表达谱数据,来源于 Cathgen Registry,聚焦冠心病患者在接受心导管检查之前的基因表达情况。Cathgen Registry 是杜克大学运行的单中心心导管实验室队列,目标是识别与冠状动脉疾病相关的生物标志物。数据集按冠状动脉狭窄程度将样本分为三类:病例组(标记为2)为存在一支以上主要血管狭窄≥70%,或两支以上动脉狭窄≥50%的患者;中间组(标记为1)为管腔狭窄程度大于25%但小于50%的患者;对照组(标记为0)为管腔狭窄程度≤25%的患者。该数据集在分类上归入循环系统疾病下的其他类别,主题标签为转录组学,可通过 omicsdi.org 获取。

【数据集背景】

Cathgen Registry 是杜克大学开展的单中心心导管实验室队列研究,其设立目的是识别与冠状动脉疾病相关的生物标志物。该数据集正是基于这一队列,对接受心导管检查前的患者全血细胞进行基因表达谱分析,以期从转录层面刻画不同冠状动脉狭窄状态之间的差异。冠心病作为循环系统疾病的重要类型,其分子层面的特征描述对于理解疾病状态具有基础性意义,而本数据集提供的正是与狭窄程度分层相对应的全血细胞表达信息。

【数据内容】

数据集的核心内容是来自患者全血细胞的基因表达谱。样本按照冠状动脉狭窄程度划分为三种条件:病例组对应一支以上主要血管狭窄≥70%或两支以上动脉狭窄≥50%的患者;中间组对应管腔狭窄大于25%但小于50%的患者;对照组对应管腔狭窄≤25%的患者。数据以转录组学为主题标签,属于基因表达层面的测量结果。除上述分组定义与表达谱性质外,源站未提供关于基因数量、样本总量、表达值范围等更细化的内容。

【采集与来源】

样本采集于患者接受心导管检查之前,取材为全血细胞。数据来源于 omicsdi.org,原始队列运行于杜克大学的单中心心导管实验室。源站未提供具体的采集时间跨度、样本处理流程、测序或芯片平台等技术细节。

【适用场景】

该数据集可用于研究不同冠状动脉狭窄程度患者之间全血细胞基因表达的差异,支持与冠心病相关的生物标志物探索。由于分组明确区分了病例、中间与对照三种状态,适合用于比较分析以及候选标志物的初步筛选。此外,也可作为转录组学层面理解冠心病外周血分子特征的参考数据。源站未提供关于具体分析用途的进一步说明。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载格式、访问接口、预处理步骤或分析流程的具体说明。使用者需依据 omicsdi.org 上该数据集的条目获取进一步信息。

【质量与限制】

该数据集来自单中心队列,样本分组依据冠状动脉狭窄程度定义。源站未提供样本量、数据完整性、批次效应、质量控制指标等信息,因此无法对数据质量作出具体评价。使用时应考虑单中心来源可能带来的局限性,但源站未就此给出说明。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-20680

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全血细胞在接受心导管检查前的患者中的表达谱分析。Cathgen注册研究是一项在杜克大学开展的单中心冠状动脉导管室队列研究,旨在识别与冠状动脉疾病相关的生物标志物。实验包含3种情况:病例组(2)为在超过1条主要血管中狭窄≥70%或在超过2条动脉中狭窄≥50%的患者;中间组(1)为管腔狭窄>25%但小于50%的患者;对照组(0)为管腔狭窄≤25%的患者。

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