野生型与TET2KO小鼠Ang II处理28天后心脏中部组织转录组RNA-seq数据

该数据集为野生型(WT)与内皮特异性TET2敲除(TET2KO)小鼠在Angiotensin II输注28天后心脏中部心室区域的总RNA测序数据,来源于omicsdi.org

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时间序列分类Transcriptomics
Transcriptomic profiling (RNA-seq) of the mid-region heart tissue from wild-type (WT) and TET2KO mice following 28 days of Angiotensin II treatment.

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

野生型与TET2KO小鼠Ang II处理28天后心脏中部组织转录组RNA-seq数据

该数据集为野生型(WT)与内皮特异性TET2敲除(TET2KO)小鼠在Angiotensin II输注28天后心脏中部心室区域的总RNA测序数据,来源于omicsdi.org,主题标签为Transcriptomics,本站归类于循环系统疾病/其他。数据集聚焦于慢性Angiotensin II输注诱导的心脏重构、肥厚与纤维化背景下,内皮特异性TET2缺失对心脏微环境的影响,通过全转录组测序刻画心脏中部心室区域的整体基因表达格局,为识别与内皮TET2缺陷相关的基因表达变化、细胞外基质重塑及肥厚标志物提供数据基础。

【数据集背景】

慢性Angiotensin II(Ang II)输注是已知的心脏重构、肥厚和纤维化的诱导因素,这些过程与内皮功能障碍密切相关。为确定内皮特异性敲除TET2在应激条件下如何影响心脏微环境,研究者对野生型(WT)与内皮特异性TET2敲除(TET2KO)小鼠在Ang II输注28天后采集的心脏中部心室区域进行了总RNA测序(RNA-seq)。该数据集的建立正是围绕这一实验背景,旨在从转录组层面观察内皮TET2缺失在Ang II应激下对心脏组织基因表达的影响。

【数据内容】

该数据集的核心内容为心脏中部心室区域的总RNA测序数据,覆盖野生型(WT)与内皮特异性TET2敲除(TET2KO)两类小鼠在Ang II输注28天后的心脏组织样本。数据捕获心脏的整体转录组格局,可用于识别基因表达变化、细胞外基质重塑相关信号以及肥厚标志物,从而服务于内皮TET2缺陷相关心脏表型的分子层面分析。主题标签为Transcriptomics,表明其数据类型属于转录组学范畴。

【采集与来源】

样本来源于野生型(WT)与内皮特异性TET2敲除(TET2KO)小鼠,均在Angiotensin II输注28天后取材,取材部位为心脏中部心室区域,检测方法为总RNA测序(RNA-seq)。数据集来源站为omicsdi.org,本站分类为循环系统疾病/其他。除上述信息外,源站未提供更详细的样本数量、测序平台、试剂与流程等信息。

【适用场景】

该数据集适用于研究Angiotensin II应激条件下心脏重构、肥厚与纤维化相关转录组变化的场景,尤其适合分析内皮特异性TET2缺失对心脏微环境基因表达格局的影响;可用于筛选差异表达基因、评估细胞外基质重塑相关表达特征以及肥厚标志物的转录水平变化。主题标签为Transcriptomics,适合转录组学相关的比较分析与假设生成研究。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。使用者可依据数据集所包含的WT与TET2KO在Ang II输注28天后的心脏中部心室区域RNA-seq数据开展转录组比较分析,但具体的分析流程、标准化方式与参数设置需自行确定,源站未提供相关指引。

【质量与限制】

源站未提供质量评估信息与明确的使用限制说明。已知的实验设计为WT与内皮特异性TET2KO小鼠在Ang II输注28天后取心脏中部心室区域进行总RNA测序,样本量、测序深度、重复数及质控指标等均未在源站描述中给出,使用时应结合原始数据自行评估。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE342962

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性血管紧张素II(Ang II)输注是已知的心脏重构、肥厚和纤维化的诱导因素,这些过程与内皮功能障碍密切相关。为了确定内皮特异性TET2缺失如何影响应激状态下的心脏微环境,我们对野生型(WT)和内皮特异性TET2敲除(TET2KO)小鼠在Ang II输注28天后收获的心脏中心室区域进行了总RNA测序(RNA-seq)。该数据集捕获了心脏的整体转录组景观,有助于识别与内皮TET2缺陷相关的基因表达变化、细胞外基质重塑和肥厚标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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