急性RSV或Influenza感染患者PBMCs转录谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-34205

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究急性RSV或流感感染患者的转录谱，对因急性RSV和流感病毒感染住院的中位年龄2.4个月（范围1.5-8.6）的儿童，在微生物学确诊后提供研究入组机会。在住院42-72小时内采集他们的血样。我们排除了疑似或证实有多微生物感染、有潜在慢性疾病（即先天性心脏病、肾功能不全）、有免疫缺陷，或接受过全身性类固醇或其他免疫调节治疗的儿童。RSV队列由51名中位年龄2个月（范围1.5-3.9）的患者组成，流感队列有28名中位年龄5.5个月（范围1.4-21）的患者。对照样本来自接受择期外科手术或门诊就诊的健康儿童。为排除病毒共感染，我们对所有受试者进行了鼻咽病毒培养。我们为RSV队列招募了10名中位年龄6.7个月（范围5-10）的对照患者，为流感队列招募了12名中位年龄18.5个月（范围10.5-26）的对照患者。

我们利用微阵列技术获取了急性RSV或流感感染患者外周血单核细胞的转录谱，并将这些特征与感染RSV或流感原代气道上皮细胞的转录谱进行了比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。