肥胖女性系统性胰岛素抵抗的表观遗传特征 [BL]

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-76285

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胰岛素刺激细胞葡萄糖摄取和调节代谢的能力受损，即胰岛素抵抗（IR），将肥胖与2型糖尿病（T2D）、血脂异常和心血管疾病等代谢紊乱联系起来（Langenberg, 2012）。遗传和表观遗传因素均参与系统性IR的发生（Vaag, 2001）。IR的特征是体循环中空腹胰岛素水平升高。本研究旨在通过皮下和内脏脂肪组织的全基因组CpG甲基化和基因表达谱分析，探讨白色脂肪组织（WAT）的表观遗传失调是否与系统性IR相关。次要目的是确定外周血单核细胞中的DNA甲基化特征是否反映WAT甲基化，并能否用作系统性IR的标志物。使用Infinium Human Methylation 450 BeadChip检测法，对从SAT（皮下脂肪组织）和VAT（内脏脂肪组织）样本以及PBMCs（外周血单核细胞）中提取的DNA进行DNA甲基化分析。本数据来自PBMCs。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。