小鼠心脏心肌细胞特异性Flnc缺陷及AAV介导FLNC重建的RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE335971

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

丝蛋白C（FLNC）的功能缺失变异是扩张型心肌病（DCM）和致心律失常性心肌病（ACM）的主要遗传原因。这些变异与进行性心室功能障碍、恶性室性心律失常、心力衰竭以及心源性猝死风险增加相关。尽管当前的临床治疗可以缓解症状并减少心律失常负担，但无法直接恢复FLNC表达或解决潜在的分子缺陷。为了研究FLNC缺陷的转录后果以及FLNC恢复的分子效应，我们对对照组小鼠、心肌细胞特异性诱导型Flnc敲除（iCKO）小鼠以及接受3-内含肽腺相关病毒（AAV）系统治疗以重建全长FLNC表达的iCKO小鼠的心室组织进行了批量RNA测序。比较转录组分析确定了与Flnc缺陷相关的基因表达变化及其在AAV介导的FLNC替代后的调节。

该数据集为研究FLNC相关心肌病的分子机制以及评估遗传性心脏病的基因替代策略提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。