层流剪切应力下内皮细胞蛋白质组分析揭示KLF4介导的膜蛋白调控与振荡流的比较

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD072355

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内皮细胞（EC）是血管稳态的关键调节因子，其生理状态取决于血流产生的血流动力学力。层流剪切应力（LSS）维持内皮完整性，而振荡剪切应力（OSS）则导致内皮功能障碍，进而引发心血管疾病。为阐明这些血流模式如何调控EC反应，我们采用捕获离子迁移谱联用并行累积-串行碎裂技术，对在LSS或OSS versus静态条件下培养的人脐血管内皮细胞进行了深度蛋白质组学分析。OSS仅引起细胞形态和蛋白质组谱的有限变化，而LSS则触发细胞形状的重大改变以及与细胞表面和细胞外基质相关的蛋白质组特征。膜亚蛋白质组学分析证实了参与血流介导反应的膜效应分子的鉴定，计算机启动子整合分析提示KLF4是该效应分子簇的主要转录调控因子。

利用TeloHAEC模型，我们证明了KLF4通过增加CD34、HEG1、PI16和ITGB4的表达，驱动LSS诱导的排列和伸长。总体而言，这些发现提供了与流动相关的内皮细胞蛋白质组谱的全面资源，并强化了KLF4作为响应LSS时膜重塑关键参与者的核心作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。